48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1555 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1555  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
273 aa  548  1e-155  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312642  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3466  aminoglycoside phosphotransferase  58.3 
 
 
295 aa  310  2e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2030  hypothetical protein  59.22 
 
 
285 aa  294  1e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.528688 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2078  aminoglycoside phosphotransferase  56.18 
 
 
288 aa  283  3.0000000000000004e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0430527  normal  0.448364 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1045  hypothetical protein  34.05 
 
 
318 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5778  aminoglycoside phosphotransferase  29.85 
 
 
316 aa  72.4  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142611  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5785  hypothetical protein  32.55 
 
 
306 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5647  aminoglycoside phosphotransferase  32.58 
 
 
296 aa  69.7  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0869  aminoglycoside phosphotransferase  36.23 
 
 
305 aa  68.9  0.00000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.414495  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00570  predicted aminoglycoside phosphotransferase  29.77 
 
 
295 aa  66.2  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.254849  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7614  hypothetical protein  28.77 
 
 
302 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.883884 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3515  aminoglycoside phosphotransferase  32.44 
 
 
316 aa  63.5  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0909  aminoglycoside phosphotransferase  29.41 
 
 
341 aa  59.7  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.251306  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2661  aminoglycoside phosphotransferase  29.36 
 
 
303 aa  57.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3081  aminoglycoside phosphotransferase  27.98 
 
 
310 aa  57  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.362203  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0988  aminoglycoside phosphotransferase  32.72 
 
 
291 aa  56.6  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3449  aminoglycoside phosphotransferase  32.97 
 
 
256 aa  55.8  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3335  aminoglycoside phosphotransferase  29.17 
 
 
243 aa  55.5  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.244161  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4197  serine/threonine protein kinase  30.36 
 
 
328 aa  52.4  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0021  serine/threonine protein kinase  30.36 
 
 
328 aa  52.4  0.000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00225074  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0019  serine/threonine protein kinase  30.36 
 
 
328 aa  52.4  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000857443  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2376  hypothetical protein  30.5 
 
 
304 aa  52  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.149878 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7275  hypothetical protein  32.26 
 
 
298 aa  49.3  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.271977  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4801  hypothetical protein  30.04 
 
 
309 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.615478 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0301  serine/threonine protein kinase  28.82 
 
 
345 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.620719  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4715  hypothetical protein  30.04 
 
 
309 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.27974  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3839  serine/threonine protein kinase  28.24 
 
 
330 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0038  aminoglycoside phosphotransferase  34.94 
 
 
298 aa  47.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3344  aminoglycoside phosphotransferase  27.12 
 
 
318 aa  46.6  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.779902 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1106  aminoglycoside phosphotransferase  28.37 
 
 
303 aa  45.8  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.577893  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4351  homoserine kinase type II (protein kinase fold)  32.73 
 
 
313 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0866  hypothetical protein  22.07 
 
 
238 aa  45.1  0.001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3643  serine/threonine protein kinase  27.54 
 
 
351 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0800606  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5100  hypothetical protein  29.68 
 
 
309 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.189048 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002046  YihE protein required for LPS synthesis  25.29 
 
 
334 aa  44.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0332  serine/threonine protein kinase  28.14 
 
 
345 aa  43.9  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1107  serine/threonine protein kinase  28.48 
 
 
329 aa  43.9  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4843  serine/threonine protein kinase  29.09 
 
 
324 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000540722  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2484  serine/threonine protein kinase  24.24 
 
 
340 aa  43.1  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3141  serine/threonine protein kinase  31.37 
 
 
355 aa  43.1  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.165863  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4154  serine/threonine protein kinase  28.49 
 
 
340 aa  43.1  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1765  aminoglycoside phosphotransferase  51.35 
 
 
340 aa  42.7  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.436395 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4061  serine/threonine protein kinase  27.75 
 
 
340 aa  42.4  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0202985  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4890  serine/threonine protein kinase  27.06 
 
 
328 aa  42.4  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000036631  hitchhiker  0.000000828535 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4036  serine/threonine protein kinase  27.75 
 
 
340 aa  42.4  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.171931  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4194  serine/threonine protein kinase  25.43 
 
 
334 aa  42.4  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0129654  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3959  serine/threonine protein kinase  27.75 
 
 
340 aa  42.4  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2871  aminoglycoside phosphotransferase  38.24 
 
 
358 aa  42  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.129273  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>