37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1987 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1987  hypothetical protein  100 
 
 
317 aa  656    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.908113  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1772  aminoglycoside phosphotransferase  53.66 
 
 
303 aa  342  4e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1735  hypothetical protein  50.34 
 
 
303 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.555806  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1778  aminoglycoside phosphotransferase  48.15 
 
 
302 aa  302  4.0000000000000003e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.433821  hitchhiker  0.000309489 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0604  aminoglycoside phosphotransferase  48.15 
 
 
302 aa  302  4.0000000000000003e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.188833  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1516  aminoglycoside phosphotransferase  47.12 
 
 
302 aa  298  1e-79  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.319617  hitchhiker  0.0000160079 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0396  aminoglycoside phosphotransferase  47 
 
 
316 aa  291  9e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.719796  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2016  hypothetical protein  35.29 
 
 
310 aa  204  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.36477  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2261  hypothetical protein  35.69 
 
 
310 aa  203  3e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7087300000000002e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2056  aminoglycoside phosphotransferase  35.44 
 
 
310 aa  202  6e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.224852  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2233  hypothetical protein  35.71 
 
 
310 aa  202  8e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2079  hypothetical protein  35.71 
 
 
310 aa  202  8e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136759  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2217  hypothetical protein  35.69 
 
 
310 aa  202  9e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2017  hypothetical protein  35.71 
 
 
310 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000163983  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2345  hypothetical protein  35.34 
 
 
310 aa  200  3e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0609784  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2263  hypothetical protein  35.56 
 
 
311 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0394341  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3107  hypothetical protein  34.98 
 
 
310 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.655374  hitchhiker  0.000000000942789 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1322  aminoglycoside phosphotransferase  33.11 
 
 
313 aa  154  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.92543  normal  0.0124047 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2858  hypothetical protein  29.64 
 
 
308 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.302203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3072  hypothetical protein  29.74 
 
 
305 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.44966  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3066  hypothetical protein  29.32 
 
 
308 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3081  hypothetical protein  29.32 
 
 
308 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2830  aminoglycoside phosphotransferase  29.64 
 
 
308 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2181  aminoglycoside phosphotransferase  29.74 
 
 
312 aa  133  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.655374  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3097  hypothetical protein  29.31 
 
 
308 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00133885  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2790  aminoglycoside phosphotransferase  29.32 
 
 
308 aa  132  5e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2852  aminoglycoside phosphotransferase  30.39 
 
 
312 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00333465  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2047  hypothetical protein  53.27 
 
 
115 aa  129  5.0000000000000004e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000025709  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3100  hypothetical protein  28.43 
 
 
305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.302661  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0884  hypothetical protein  29.26 
 
 
298 aa  71.2  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000856373  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2943  aminoglycoside phosphotransferase  21.71 
 
 
346 aa  51.6  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1003  aminoglycoside phosphotransferase  21.53 
 
 
291 aa  49.3  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6361  aminoglycoside phosphotransferase  22.8 
 
 
342 aa  49.3  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00784596  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1820  aminoglycoside phosphotransferase  22.54 
 
 
352 aa  45.8  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0461  aminoglycoside phosphotransferase  25.33 
 
 
325 aa  44.3  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0370  aminoglycoside phosphotransferase  25.85 
 
 
345 aa  42.7  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.380981  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5104  putative tyrosine protein kinase  22.22 
 
 
352 aa  42.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>