More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1889 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0798  glutamine synthetase, type I  68.7 
 
 
476 aa  724    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0671086  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1710  glutamine synthetase, type I  68.28 
 
 
475 aa  723    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.102718  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1307  glutamine synthetase, type I  68.91 
 
 
476 aa  728    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00102635  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1889  glutamine synthetase type I  100 
 
 
476 aa  998    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.489598  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0722  glutamine synthetase, type I  68.91 
 
 
476 aa  726    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000425202  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1007  glutamine synthetase  68.91 
 
 
476 aa  727    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.134746  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0276  glutamine synthetase, type I  69.96 
 
 
476 aa  732    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00270748  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1661  glutamine synthetase, type I  74.79 
 
 
476 aa  786    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000859271  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1054  glutamine synthetase, type I  72.27 
 
 
475 aa  754    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1446  glutamine synthetase, type I  69.12 
 
 
476 aa  730    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0279713  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2086  L-glutamine synthetase  54.64 
 
 
469 aa  521  1e-147  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1482  glutamine synthetase, type I  52.32 
 
 
486 aa  489  1e-137  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.140298 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3057  glutamine synthetase, type I  52.01 
 
 
477 aa  481  1e-134  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1677  glutamine synthetase, type I  56.53 
 
 
469 aa  475  1e-133  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.20708  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0109  glutamine synthetase, type I  54.26 
 
 
469 aa  476  1e-133  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0159968 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2503  L-glutamine synthetase  54.26 
 
 
469 aa  471  1e-132  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2577  glutamine synthetase, type I  55.38 
 
 
469 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0018456 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2447  L-glutamine synthetase  52.43 
 
 
469 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000663157  normal  0.627603 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2901  glutamine synthetase, type I  51.05 
 
 
469 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0513537  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2558  glutamine synthetase, type I  50.63 
 
 
469 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0728767  normal  0.913477 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0243  L-glutamine synthetase  51.59 
 
 
469 aa  468  9.999999999999999e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2234  glutamine synthetase, type I  54 
 
 
469 aa  465  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.356963  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0149  glutamine synthetase, type I  50.21 
 
 
470 aa  466  9.999999999999999e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03568  glutamine synthetase, type I  53.71 
 
 
467 aa  465  9.999999999999999e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.577755  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0209  glutamine synthetase, type I  52.33 
 
 
469 aa  467  9.999999999999999e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.692281  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0988  L-glutamine synthetase  51.16 
 
 
473 aa  466  9.999999999999999e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149677  normal  0.900766 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0466  glutamine synthetase, type I  54.04 
 
 
471 aa  461  1e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3315  glutamine synthetase, type I  50.42 
 
 
469 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.651786  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2318  glutamine synthetase  54.26 
 
 
469 aa  463  1e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0626  glutamine synthetase, type I  54.04 
 
 
471 aa  461  1e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1004  glutamine synthetase, type I  51.72 
 
 
469 aa  460  9.999999999999999e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1389  glutamine synthetase, type I  50.21 
 
 
469 aa  460  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.737079  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0970  glutamine synthetase, type I  51.72 
 
 
469 aa  460  9.999999999999999e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.545228  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2375  glutamine synthetase  50 
 
 
469 aa  458  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.290662  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3244  glutamine synthetase, type I  51.84 
 
 
468 aa  459  9.999999999999999e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.877746  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3585  glutamine synthetase, type I  49.89 
 
 
471 aa  461  9.999999999999999e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.110089  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1108  L-glutamine synthetase  48.84 
 
 
469 aa  461  9.999999999999999e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0181625  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1515  L-glutamine synthetase  49.58 
 
 
468 aa  459  9.999999999999999e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.274657 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2386  glutamine synthetase, type I  50.84 
 
 
469 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.35436  normal  0.41443 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0013  L-glutamine synthetase  53.9 
 
 
471 aa  458  9.999999999999999e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.778405 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1582  glutamine synthetase, type I  53.56 
 
 
471 aa  457  1e-127  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0733  glutamine synthetase, type I  50.54 
 
 
469 aa  455  1e-127  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.02678  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4581  L-glutamine synthetase  49.89 
 
 
469 aa  456  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.163262  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4239  glutamine synthetase  52.21 
 
 
469 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1904  glutamine synthetase type I  51.19 
 
 
469 aa  457  1e-127  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.394003 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4218  glutamine synthetase  52.21 
 
 
469 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.670348  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4335  glutamine synthetase  52.21 
 
 
469 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4289  glutamine synthetase  52.21 
 
 
469 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.438385  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4396  glutamine synthetase  52.21 
 
 
469 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03755  glutamine synthetase  51.79 
 
 
469 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4116  glutamine synthetase, type I  51.79 
 
 
469 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1086  glutamine synthetase, type I  53.24 
 
 
471 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1920  glutamine synthetase, type I  50 
 
 
469 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.656654  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1258  glutamine synthetase protein  53.24 
 
 
471 aa  451  1.0000000000000001e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.859472 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3259  glutamine synthetase, type I  54.04 
 
 
469 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4346  glutamine synthetase  51.79 
 
 
469 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4146  glutamine synthetase  51.79 
 
 
469 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.216906 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4575  glutamine synthetase, type I  49.25 
 
 
470 aa  454  1.0000000000000001e-126  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.856716 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2087  glutamine synthetase, type I  50.43 
 
 
469 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1736  glutamine synthetase, type I  50 
 
 
469 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.654979  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1090  glutamine synthetase, type I  52.02 
 
 
469 aa  453  1.0000000000000001e-126  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.603235  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4097  glutamine synthetase  51.79 
 
 
469 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1481  glutamine synthetase, type I  53.01 
 
 
471 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.494323  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1839  glutamine synthetase  49.78 
 
 
468 aa  455  1.0000000000000001e-126  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.724651  normal  0.76647 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5316  glutamine synthetase  51.79 
 
 
469 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.961991  normal  0.126376 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4392  glutamine synthetase  51.79 
 
 
469 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.519647  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2062  L-glutamine synthetase  52.78 
 
 
471 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00147579  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1022  L-glutamine synthetase  48.73 
 
 
468 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.562141  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1544  L-glutamine synthetase  49.68 
 
 
469 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4255  glutamine synthetase  51.79 
 
 
469 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.743533 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1330  L-glutamine synthetase  50.11 
 
 
467 aa  453  1.0000000000000001e-126  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.523028  normal  0.654119 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03704  hypothetical protein  51.79 
 
 
469 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00588  glutamine synthetase  53.14 
 
 
469 aa  453  1.0000000000000001e-126  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1179  glutamine synthetase, type I  53.24 
 
 
471 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4408  glutamine synthetase, type I  49.68 
 
 
474 aa  448  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0697  glutamine synthetase, type I  51.65 
 
 
471 aa  448  1e-125  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.817374 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4385  glutamine synthetase, type I  49.89 
 
 
474 aa  450  1e-125  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2057  L-glutamine synthetase  52.46 
 
 
471 aa  449  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.648979  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4156  glutamine synthetase  51.48 
 
 
469 aa  451  1e-125  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.35339  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2853  glutamine synthetase, type I  49.58 
 
 
469 aa  449  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.725754  normal  0.0528794 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2156  L-glutamine synthetase  47.89 
 
 
473 aa  451  1e-125  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0673307 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1632  glutamine synthetase, type I  52.23 
 
 
471 aa  451  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4252  L-glutamine synthetase  49.89 
 
 
474 aa  450  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.631725  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3554  glutamine synthetase  54.48 
 
 
469 aa  451  1e-125  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0502  L-glutamine synthetase  51.49 
 
 
468 aa  450  1e-125  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000320948  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1522  L-glutamine synthetase  51.9 
 
 
471 aa  449  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000686427  normal  0.138561 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1217  glutamine synthetase, type I  53.38 
 
 
471 aa  451  1e-125  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45850  glutamine synthetase, type I; GlnA  52.44 
 
 
467 aa  451  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3834  L-glutamine synthetase  47.59 
 
 
473 aa  448  1e-125  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2615  glutamine synthetase, type I  52.34 
 
 
471 aa  450  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0119922  normal  0.711308 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4096  glutamine synthetase  51.79 
 
 
469 aa  450  1e-125  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001905  glutamine synthetase type I  52.91 
 
 
469 aa  451  1e-125  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.168817  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2940  glutamine synthetase  52.24 
 
 
469 aa  451  1e-125  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2076  L-glutamine synthetase  52.57 
 
 
472 aa  448  1e-125  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.943231  normal  0.983586 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1124  glutamate--ammonia ligase  51.35 
 
 
469 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.453717  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2634  glutamine synthetase, type I  52.35 
 
 
471 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.675717  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2770  glutamine synthetase, type I  52.35 
 
 
471 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1255  glutamine synthetase, type I  51.21 
 
 
471 aa  446  1.0000000000000001e-124  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.027099  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2167  glutamine synthetase, type I  51.9 
 
 
471 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1844  glutamine synthetase, type I  52.35 
 
 
471 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.43293  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>