More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1007 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE0798  glutamine synthetase, type I  87.18 
 
 		 476 aa  900    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0671086  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0722  glutamine synthetase, type I  87.39 
 
 		 476 aa  902    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000425202  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1889  glutamine synthetase type I  68.91 
 
 		 476 aa  727    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.489598  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1446  glutamine synthetase, type I  75.21 
 
 		 476 aa  788    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0279713  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1007  glutamine synthetase  100 
 
 		 476 aa  998    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.134746  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1661  glutamine synthetase, type I  73.11 
 
 		 476 aa  761    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000859271  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1307  glutamine synthetase, type I  87.18 
 
 		 476 aa  899    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00102635  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0276  glutamine synthetase, type I  74.58 
 
 		 476 aa  772    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00270748  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1710  glutamine synthetase, type I  72.9 
 
 		 475 aa  750    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.102718  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1054  glutamine synthetase, type I  75.21 
 
 		 475 aa  778    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2086  L-glutamine synthetase  52.95 
 
 		 469 aa  508  1e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2577  glutamine synthetase, type I  54.51 
 
 		 469 aa  478  1e-134  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018456 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1482  glutamine synthetase, type I  50.32 
 
 		 486 aa  476  1e-133  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.140298 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0243  L-glutamine synthetase  52.56 
 
 		 469 aa  473  1e-132  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3077  glutamine synthetase, type I  51.4 
 
 		 470 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00183784  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1184  glutamine synthetase, type I  51.62 
 
 		 470 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103197 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3057  glutamine synthetase, type I  49.47 
 
 		 477 aa  467  9.999999999999999e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3259  glutamine synthetase, type I  54.85 
 
 		 469 aa  468  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2228  glutamine synthetase, type I  51.4 
 
 		 470 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000244418  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1389  glutamine synthetase, type I  49.68 
 
 		 469 aa  465  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.737079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2375  glutamine synthetase  49.25 
 
 		 469 aa  461  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.290662  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0109  glutamine synthetase, type I  50 
 
 		 469 aa  464  1e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0159968 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03568  glutamine synthetase, type I  51.19 
 
 		 467 aa  462  1e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.577755  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1835  glutamine synthetase, type I  49.68 
 
 		 470 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.264804  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1677  glutamine synthetase, type I  52.7 
 
 		 469 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.20708  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1736  glutamine synthetase, type I  49.04 
 
 		 469 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.654979  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1880  glutamine synthetase, type I  49.47 
 
 		 470 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000193133  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1920  glutamine synthetase, type I  49.04 
 
 		 469 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.656654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2652  glutamine synthetase type I  52.11 
 
 		 469 aa  459  9.999999999999999e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127344  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1544  L-glutamine synthetase  49.47 
 
 		 469 aa  461  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45850  glutamine synthetase, type I; GlnA  52.69 
 
 		 467 aa  460  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1004  glutamine synthetase, type I  48.1 
 
 		 469 aa  455  1e-127  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1352  L-glutamine synthetase  49.47 
 
 		 470 aa  456  1e-127  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000612726  hitchhiker  0.000000000000122735 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0733  glutamine synthetase, type I  49.24 
 
 		 469 aa  455  1e-127  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.02678  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2156  L-glutamine synthetase  47.77 
 
 		 473 aa  455  1e-127  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0673307 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2901  glutamine synthetase, type I  48.08 
 
 		 469 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0513537  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3244  glutamine synthetase, type I  50.22 
 
 		 468 aa  455  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.877746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0988  L-glutamine synthetase  49.04 
 
 		 473 aa  456  1e-127  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149677  normal  0.900766 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1681  glutamine synthetase, type I  49.89 
 
 		 470 aa  457  1e-127  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000311602  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0626  glutamine synthetase, type I  52.03 
 
 		 471 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2087  glutamine synthetase, type I  47.26 
 
 		 469 aa  451  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4575  glutamine synthetase, type I  47.13 
 
 		 470 aa  452  1.0000000000000001e-126  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.856716 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2558  glutamine synthetase, type I  47.86 
 
 		 469 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0728767  normal  0.913477 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0209  glutamine synthetase, type I  51.51 
 
 		 469 aa  454  1.0000000000000001e-126  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.692281  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2447  L-glutamine synthetase  50.21 
 
 		 469 aa  455  1.0000000000000001e-126  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000663157  normal  0.627603 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5853  glutamine synthetase  52.57 
 
 		 469 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343891  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001905  glutamine synthetase type I  50.95 
 
 		 469 aa  452  1.0000000000000001e-126  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.168817  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3315  glutamine synthetase, type I  47.65 
 
 		 469 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.651786  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0970  glutamine synthetase, type I  47.89 
 
 		 469 aa  454  1.0000000000000001e-126  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.545228  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0466  glutamine synthetase, type I  52.03 
 
 		 471 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67600  glutamine synthetase  52.57 
 
 		 469 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2318  glutamine synthetase  50.74 
 
 		 469 aa  452  1.0000000000000001e-126  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00588  glutamine synthetase  50.95 
 
 		 469 aa  455  1.0000000000000001e-126  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0359  glutamine synthetase, type I  50.32 
 
 		 468 aa  448  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1904  glutamine synthetase type I  47.36 
 
 		 469 aa  450  1e-125  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.394003 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0344  L-glutamine synthetase  50.75 
 
 		 468 aa  451  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5098  glutamine synthetase, type I  50.75 
 
 		 468 aa  448  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1108  L-glutamine synthetase  47.97 
 
 		 469 aa  451  1e-125  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0181625  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4581  L-glutamine synthetase  48.48 
 
 		 469 aa  449  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.163262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0243  glutamine synthetase, type I  49.04 
 
 		 475 aa  450  1e-125  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.823516  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0932  glutamine synthetase, type I  48.2 
 
 		 474 aa  450  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.017954 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0418  glutamine synthetase, type I  50.75 
 
 		 468 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.910839  normal  0.393257 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03755  glutamine synthetase  49.26 
 
 		 469 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4116  glutamine synthetase, type I  49.26 
 
 		 469 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5046  glutamine synthetase, type I  50.75 
 
 		 468 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.114417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1090  glutamine synthetase, type I  49.35 
 
 		 469 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.603235  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4396  glutamine synthetase  49.26 
 
 		 469 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4255  glutamine synthetase  49.26 
 
 		 469 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.743533 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4239  glutamine synthetase  49.26 
 
 		 469 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4140  L-glutamine synthetase  52.57 
 
 		 468 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1632  glutamine synthetase, type I  49.79 
 
 		 471 aa  448  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0988  L-glutamine synthetase  47.58 
 
 		 474 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0372208  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2057  L-glutamine synthetase  49.9 
 
 		 471 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.648979  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2503  L-glutamine synthetase  49.89 
 
 		 469 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4289  glutamine synthetase  49.26 
 
 		 469 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.438385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4318  glutamine synthetase, type I  47.47 
 
 		 476 aa  448  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4218  glutamine synthetase  49.26 
 
 		 469 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.670348  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03704  hypothetical protein  49.26 
 
 		 469 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4097  glutamine synthetase  49.26 
 
 		 469 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1179  glutamine synthetase, type I  49.47 
 
 		 471 aa  448  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4346  glutamine synthetase  49.26 
 
 		 469 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4335  glutamine synthetase  49.26 
 
 		 469 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2386  glutamine synthetase, type I  47.44 
 
 		 469 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.35436  normal  0.41443 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1645  glutamine synthetase, type I  51.29 
 
 		 469 aa  446  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.356376  normal  0.294461 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2234  glutamine synthetase, type I  47.84 
 
 		 469 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.356963  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4920  glutamine synthetase, type I  50.75 
 
 		 468 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0149  glutamine synthetase, type I  46.71 
 
 		 470 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5316  glutamine synthetase  49.26 
 
 		 469 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.961991  normal  0.126376 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0013  L-glutamine synthetase  50.21 
 
 		 471 aa  447  1.0000000000000001e-124  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.778405 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4146  glutamine synthetase  49.26 
 
 		 469 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.216906 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4392  glutamine synthetase  49.26 
 
 		 469 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.519647  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1086  glutamine synthetase, type I  49.47 
 
 		 471 aa  448  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1582  glutamine synthetase, type I  50.53 
 
 		 471 aa  442  1e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1258  glutamine synthetase protein  49.16 
 
 		 471 aa  444  1e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.859472 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2203  glutamine synthetase, type I  46.06 
 
 		 473 aa  442  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000380736 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0147  L-glutamine synthetase  47.02 
 
 		 474 aa  445  1e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4096  glutamine synthetase  48.83 
 
 		 469 aa  442  1e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4156  glutamine synthetase  48.31 
 
 		 469 aa  443  1e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.35339  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0502  L-glutamine synthetase  49.36 
 
 		 468 aa  443  1e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000320948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3959  glutamine synthetase  48.84 
 
 		 469 aa  443  1e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>