More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1710 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009707  JJD26997_1307  glutamine synthetase, type I  72.27 
 
 		 476 aa  751    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00102635  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0798  glutamine synthetase, type I  72.69 
 
 		 476 aa  755    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0671086  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1710  glutamine synthetase, type I  100 
 
 		 475 aa  995    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.102718  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1889  glutamine synthetase type I  68.28 
 
 		 476 aa  723    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.489598  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0722  glutamine synthetase, type I  72.48 
 
 		 476 aa  753    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000425202  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1661  glutamine synthetase, type I  78.57 
 
 		 476 aa  811    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000859271  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0276  glutamine synthetase, type I  76.68 
 
 		 476 aa  791    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00270748  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1007  glutamine synthetase  72.9 
 
 		 476 aa  750    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.134746  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1446  glutamine synthetase, type I  77.1 
 
 		 476 aa  796    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0279713  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1054  glutamine synthetase, type I  82.32 
 
 		 475 aa  849    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2086  L-glutamine synthetase  54.85 
 
 		 469 aa  523  1e-147  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3057  glutamine synthetase, type I  53.28 
 
 		 477 aa  490  1e-137  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1482  glutamine synthetase, type I  52.65 
 
 		 486 aa  485  1e-136  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.140298 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2577  glutamine synthetase, type I  55.88 
 
 		 469 aa  484  1e-135  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018456 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0109  glutamine synthetase, type I  50.63 
 
 		 469 aa  473  1e-132  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0159968 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0988  L-glutamine synthetase  50.96 
 
 		 473 aa  472  1e-132  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149677  normal  0.900766 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03568  glutamine synthetase, type I  51.96 
 
 		 467 aa  470  1.0000000000000001e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.577755  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1108  L-glutamine synthetase  50.74 
 
 		 469 aa  471  1.0000000000000001e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0181625  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0209  glutamine synthetase, type I  51.16 
 
 		 469 aa  465  9.999999999999999e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.692281  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2853  glutamine synthetase, type I  50.21 
 
 		 469 aa  464  1e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.725754  normal  0.0528794 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2375  glutamine synthetase  51.41 
 
 		 469 aa  464  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.290662  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1920  glutamine synthetase, type I  50.21 
 
 		 469 aa  462  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.656654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1736  glutamine synthetase, type I  50.21 
 
 		 469 aa  463  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.654979  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2447  L-glutamine synthetase  50.64 
 
 		 469 aa  461  1e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000663157  normal  0.627603 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0149  glutamine synthetase, type I  50.32 
 
 		 470 aa  464  1e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0466  glutamine synthetase, type I  52.81 
 
 		 471 aa  464  1e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3244  glutamine synthetase, type I  52.49 
 
 		 468 aa  464  1e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.877746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0626  glutamine synthetase, type I  52.81 
 
 		 471 aa  464  1e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1004  glutamine synthetase, type I  51.3 
 
 		 469 aa  461  9.999999999999999e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0970  glutamine synthetase, type I  51.08 
 
 		 469 aa  461  9.999999999999999e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.545228  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2503  L-glutamine synthetase  50.42 
 
 		 469 aa  458  9.999999999999999e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1389  glutamine synthetase, type I  49.79 
 
 		 469 aa  459  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.737079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0243  L-glutamine synthetase  51.5 
 
 		 469 aa  459  9.999999999999999e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1330  L-glutamine synthetase  50.43 
 
 		 467 aa  461  9.999999999999999e-129  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.523028  normal  0.654119 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1184  glutamine synthetase, type I  50.54 
 
 		 470 aa  457  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103197 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0988  L-glutamine synthetase  49.68 
 
 		 474 aa  457  1e-127  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0372208  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3077  glutamine synthetase, type I  50.75 
 
 		 470 aa  457  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00183784  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2652  glutamine synthetase type I  52.55 
 
 		 469 aa  458  1e-127  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127344  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1352  L-glutamine synthetase  50.64 
 
 		 470 aa  456  1e-127  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000612726  hitchhiker  0.000000000000122735 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2156  L-glutamine synthetase  48.52 
 
 		 473 aa  457  1e-127  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0673307 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01591  glutamine synthetase  51.55 
 
 		 469 aa  456  1e-127  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1544  L-glutamine synthetase  51.19 
 
 		 469 aa  458  1e-127  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1632  glutamine synthetase, type I  50.94 
 
 		 471 aa  456  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2228  glutamine synthetase, type I  50.54 
 
 		 470 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000244418  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00588  glutamine synthetase  50.67 
 
 		 469 aa  452  1.0000000000000001e-126  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2087  glutamine synthetase, type I  50.76 
 
 		 469 aa  455  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0837  glutamine synthetase, type I  48.72 
 
 		 473 aa  451  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2318  glutamine synthetase  50.89 
 
 		 469 aa  453  1.0000000000000001e-126  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1880  glutamine synthetase, type I  50 
 
 		 470 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000193133  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2901  glutamine synthetase, type I  48.2 
 
 		 469 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0513537  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0013  L-glutamine synthetase  53.18 
 
 		 471 aa  452  1.0000000000000001e-126  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.778405 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0733  glutamine synthetase, type I  49.67 
 
 		 469 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.02678  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0808  glutamine synthetase, type I  48.72 
 
 		 473 aa  451  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3259  glutamine synthetase, type I  53.62 
 
 		 469 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4831  L-glutamine synthetase  49.57 
 
 		 470 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.840824 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1835  glutamine synthetase, type I  49.79 
 
 		 470 aa  450  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.264804  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1677  glutamine synthetase, type I  52.68 
 
 		 469 aa  450  1e-125  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.20708  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1258  glutamine synthetase protein  49.68 
 
 		 471 aa  449  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.859472 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1122  glutamine synthetase, type I  50 
 
 		 471 aa  448  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.744153  normal  0.286491 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1086  glutamine synthetase, type I  49.47 
 
 		 471 aa  451  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2167  glutamine synthetase, type I  49.9 
 
 		 471 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1743  glutamine synthetase, type I  50.21 
 
 		 471 aa  448  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0103435  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3067  glutamine synthetase, type I  50.21 
 
 		 471 aa  448  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0932  glutamine synthetase, type I  49.89 
 
 		 474 aa  449  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.017954 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1179  glutamine synthetase, type I  49.47 
 
 		 471 aa  451  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4400  glutamine synthetase, type I  48.61 
 
 		 474 aa  449  1e-125  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.756911 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2057  L-glutamine synthetase  49.58 
 
 		 471 aa  448  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.648979  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1904  glutamine synthetase type I  49.02 
 
 		 469 aa  449  1e-125  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.394003 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2770  glutamine synthetase, type I  50.21 
 
 		 471 aa  448  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5458  L-glutamine synthetase  50.1 
 
 		 471 aa  451  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2690  glutamine synthetase, type I  50.21 
 
 		 471 aa  448  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363282  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2203  glutamine synthetase, type I  48.09 
 
 		 473 aa  451  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000380736 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2253  glutamine synthetase, type I  50.21 
 
 		 471 aa  448  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1524  glutamine synthetase, type I  50.21 
 
 		 471 aa  448  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2558  glutamine synthetase, type I  48.2 
 
 		 469 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0728767  normal  0.913477 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0502  L-glutamine synthetase  50.64 
 
 		 468 aa  449  1e-125  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000320948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2386  glutamine synthetase, type I  47.99 
 
 		 469 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.35436  normal  0.41443 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4575  glutamine synthetase, type I  47.22 
 
 		 470 aa  451  1e-125  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.856716 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001905  glutamine synthetase type I  50.67 
 
 		 469 aa  450  1e-125  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.168817  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2634  glutamine synthetase, type I  50.21 
 
 		 471 aa  448  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.675717  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1022  L-glutamine synthetase  49.35 
 
 		 468 aa  448  1e-125  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.562141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5928  glutamine synthetase, type I  49.9 
 
 		 471 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1025  glutamine synthetase  49.79 
 
 		 469 aa  450  1e-125  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2186  glutamine synthetase, type I  50 
 
 		 471 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.179605  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2149  glutamine synthetase, type I  49.9 
 
 		 471 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1481  glutamine synthetase, type I  50.84 
 
 		 471 aa  449  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.494323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2059  glutamine synthetase, type I  49.9 
 
 		 471 aa  450  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1090  glutamine synthetase, type I  50.22 
 
 		 469 aa  449  1e-125  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.603235  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16500  L-glutamine synthetase  47.67 
 
 		 476 aa  447  1.0000000000000001e-124  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.399242  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2076  L-glutamine synthetase  51.33 
 
 		 472 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.943231  normal  0.983586 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5127  glutamine synthetase, type I  48.52 
 
 		 469 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.032898  normal  0.611689 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1844  glutamine synthetase, type I  49.79 
 
 		 471 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.43293  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4252  L-glutamine synthetase  49.04 
 
 		 474 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.631725  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4408  glutamine synthetase, type I  48.82 
 
 		 474 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4385  glutamine synthetase, type I  49.04 
 
 		 474 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1217  glutamine synthetase, type I  50.89 
 
 		 471 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2615  glutamine synthetase, type I  50.21 
 
 		 471 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0119922  normal  0.711308 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3585  glutamine synthetase, type I  47.26 
 
 		 471 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.110089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1681  glutamine synthetase, type I  49.36 
 
 		 470 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000311602  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0243  glutamine synthetase, type I  49.04 
 
 		 475 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.823516  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>