85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0619 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0619  sulfide-quinone reductase, putative  100 
 
 		 489 aa  1005    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0071  sulfide-quinone reductase, putative  59.51 
 
 		 484 aa  600  1e-170  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1347  sulfide-quinone reductase, putative  56.85 
 
 		 484 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0882  sulfide-quinone reductase, putative  56.65 
 
 		 484 aa  572  1.0000000000000001e-162  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.638207  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1163  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  47.13 
 
 		 473 aa  430  1e-119  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000197587  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2428  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.87 
 
 		 477 aa  385  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2161  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.26 
 
 		 477 aa  383  1e-105  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.613284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2405  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.37 
 
 		 477 aa  380  1e-104  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0868256  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2569  sulfide-quinone reductase  39.55 
 
 		 477 aa  374  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000267318  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2046  sulfide-quinone reductase, putative  37.53 
 
 		 477 aa  352  7e-96  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.972392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1170  sulfide-quinone reductase  29.49 
 
 		 435 aa  169  1e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0596  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.48 
 
 		 425 aa  167  4e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000167725  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2225  sulfide-quinone reductase  30.72 
 
 		 422 aa  163  7e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.659871 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4096  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.77 
 
 		 430 aa  163  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.715677 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2155  sulfide-quinone reductase  29.33 
 
 		 424 aa  162  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0239  sulfide-quinone reductase  29.89 
 
 		 426 aa  162  1e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3759  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.47 
 
 		 428 aa  162  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3722  sulfide-quinone reductase  30.31 
 
 		 428 aa  162  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.094344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2289  sulfide-quinone reductase  30.32 
 
 		 430 aa  160  6e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2831  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.66 
 
 		 423 aa  155  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.697363  hitchhiker  0.00254819 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1326  sulfide-quinone reductase  27.71 
 
 		 427 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.049484  normal  0.215717 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1570  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  28.91 
 
 		 402 aa  154  4e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0254899 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2477  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.08 
 
 		 426 aa  141  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4230.1  quinone reductase  29.11 
 
 		 321 aa  141  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0055  sulfide:quinone oxidoreductase  27.62 
 
 		 423 aa  138  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3378  sulfide-quinone reductase  25.36 
 
 		 429 aa  133  6e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.252874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1390  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.95 
 
 		 435 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0862437  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1792  sulfide-quinone reductase, putative  31.53 
 
 		 434 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1469  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.53 
 
 		 434 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.304083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2039  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.07 
 
 		 432 aa  129  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2448  sulfide-quinone reductase  28.97 
 
 		 427 aa  128  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.650431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0125  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.18 
 
 		 428 aa  127  3e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000144502  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0163  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.04 
 
 		 403 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.505283  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3562  sulfide-quinone reductase  28.39 
 
 		 426 aa  126  9e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3245  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.14 
 
 		 426 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.552628  normal  0.391539 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3722  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.25 
 
 		 434 aa  114  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.860227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1688  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.43 
 
 		 436 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00724142 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1407  sulfide-quinone reductase  23.33 
 
 		 532 aa  85.5  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2059  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.66 
 
 		 409 aa  72  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.761901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1298  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.75 
 
 		 489 aa  67  0.0000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.53579  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1494  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.73 
 
 		 456 aa  63.5  0.000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.169709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1785  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.48 
 
 		 382 aa  62.4  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1529  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.45 
 
 		 389 aa  61.6  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.932731  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2576  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.24 
 
 		 404 aa  61.2  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.581088  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0298  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.29 
 
 		 382 aa  59.7  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000682999  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1665  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.67 
 
 		 461 aa  59.3  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49591  predicted protein  26.21 
 
 		 202 aa  58.9  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0157448  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1051  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  23.56 
 
 		 390 aa  57  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0297  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.92 
 
 		 381 aa  55.1  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00092507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2082  twin-arginine translocation pathway signal  24.07 
 
 		 491 aa  55.1  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44781  NADH dehydrogenase, extrinsic  23.53 
 
 		 589 aa  53.1  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.590439  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0523  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  21.32 
 
 		 383 aa  52.8  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.601126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1554  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  21.52 
 
 		 408 aa  51.6  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.138705 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08346  conserved hypothetical protein  23.7 
 
 		 442 aa  51.6  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4614  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.11 
 
 		 413 aa  52  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.400111 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3437  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  22.28 
 
 		 379 aa  51.2  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000631471  normal  0.124537 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5137  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.16 
 
 		 377 aa  49.7  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.318607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0486  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.36 
 
 		 397 aa  49.3  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.409474  normal  0.0139232 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2307  twin-arginine translocation pathway signal  27.31 
 
 		 451 aa  48.9  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00993475  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0350  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  21.96 
 
 		 411 aa  48.9  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1517  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  22.26 
 
 		 393 aa  48.9  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0069  sulfide dehydrogenase, flavoprotein subunit, putative  19.34 
 
 		 408 aa  49.3  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0075  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  22.54 
 
 		 397 aa  49.3  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0077  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  22.54 
 
 		 397 aa  49.3  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1127  sulfide-quinone reductase  22.26 
 
 		 408 aa  48.1  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.269645 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3633  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  21.18 
 
 		 396 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.380399  normal  0.315982 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0599  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25 
 
 		 381 aa  47.4  0.0006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0369  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.72 
 
 		 402 aa  47  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1052  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.41 
 
 		 376 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1846  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  20 
 
 		 413 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4036  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  25.41 
 
 		 387 aa  45.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.417211  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1610  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  21.7 
 
 		 413 aa  45.8  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4021  hypothetical protein  23.93 
 
 		 450 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1323  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.13 
 
 		 384 aa  45.8  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00637621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1938  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.39 
 
 		 375 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1381  sulfide-quinone reductase  21.28 
 
 		 374 aa  45.1  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0624  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  22.86 
 
 		 413 aa  44.3  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0441404 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0165  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  23.21 
 
 		 379 aa  44.3  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.934981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0942  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.2 
 
 		 441 aa  43.9  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2974  NADH dehydrogenase  26.09 
 
 		 402 aa  43.9  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1802  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  22.94 
 
 		 392 aa  43.9  0.007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00556002  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0687  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.29 
 
 		 367 aa  43.5  0.008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2448  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.14 
 
 		 460 aa  43.5  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.43473  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2082  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  19.92 
 
 		 379 aa  43.1  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.107005  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1884  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  22.03 
 
 		 408 aa  43.5  0.01  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>