88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1347 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0882  sulfide-quinone reductase, putative  83.88 
 
 		 484 aa  860    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.638207  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1347  sulfide-quinone reductase, putative  100 
 
 		 484 aa  1005    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0071  sulfide-quinone reductase, putative  82.44 
 
 		 484 aa  858    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0619  sulfide-quinone reductase, putative  56.85 
 
 		 489 aa  573  1.0000000000000001e-162  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1163  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  46.07 
 
 		 473 aa  432  1e-120  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000197587  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2428  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.71 
 
 		 477 aa  389  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2405  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.55 
 
 		 477 aa  370  1e-101  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0868256  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2569  sulfide-quinone reductase  39.43 
 
 		 477 aa  369  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000267318  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2046  sulfide-quinone reductase, putative  38.4 
 
 		 477 aa  365  1e-100  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.972392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2161  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.45 
 
 		 477 aa  365  1e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.613284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3722  sulfide-quinone reductase  30.9 
 
 		 428 aa  170  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.094344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0596  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.29 
 
 		 425 aa  166  8e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000167725  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1570  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  31.3 
 
 		 402 aa  161  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0254899 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1326  sulfide-quinone reductase  29.62 
 
 		 427 aa  161  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.049484  normal  0.215717 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4096  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.48 
 
 		 430 aa  160  7e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.715677 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2225  sulfide-quinone reductase  29.45 
 
 		 422 aa  158  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.659871 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1170  sulfide-quinone reductase  27.51 
 
 		 435 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2155  sulfide-quinone reductase  29.28 
 
 		 424 aa  153  5e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2831  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.32 
 
 		 423 aa  152  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.697363  hitchhiker  0.00254819 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2289  sulfide-quinone reductase  28.54 
 
 		 430 aa  152  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0239  sulfide-quinone reductase  27.52 
 
 		 426 aa  141  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0055  sulfide:quinone oxidoreductase  26.97 
 
 		 423 aa  140  6e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1792  sulfide-quinone reductase, putative  33.13 
 
 		 434 aa  137  5e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1469  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.13 
 
 		 434 aa  137  5e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.304083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2448  sulfide-quinone reductase  29.68 
 
 		 427 aa  134  5e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.650431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3562  sulfide-quinone reductase  27.56 
 
 		 426 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3245  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.77 
 
 		 426 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.552628  normal  0.391539 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3759  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.04 
 
 		 428 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1390  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.82 
 
 		 435 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0862437  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0163  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.01 
 
 		 403 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.505283  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3378  sulfide-quinone reductase  26.33 
 
 		 429 aa  121  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.252874  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4230.1  quinone reductase  26.2 
 
 		 321 aa  121  3e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2477  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.97 
 
 		 426 aa  121  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3722  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.56 
 
 		 434 aa  113  7.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.860227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0125  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.21 
 
 		 428 aa  112  2.0000000000000002e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000144502  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1688  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.52 
 
 		 436 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00724142 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2039  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.53 
 
 		 432 aa  107  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1407  sulfide-quinone reductase  25.26 
 
 		 532 aa  78.6  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0077  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.25 
 
 		 414 aa  68.2  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1529  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.94 
 
 		 389 aa  64.3  0.000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.932731  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2059  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.25 
 
 		 409 aa  62.4  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.761901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3437  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.15 
 
 		 379 aa  60.5  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000631471  normal  0.124537 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0298  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.45 
 
 		 382 aa  58.9  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000682999  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1665  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.43 
 
 		 461 aa  58.5  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49591  predicted protein  26.62 
 
 		 202 aa  58.5  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0157448  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0099  sulfide dehydrogenase, flavoprotein subunit, putative  23.41 
 
 		 408 aa  57.4  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0444  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.61 
 
 		 375 aa  57  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000753629 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0267  sulfide quinone reductase, putative  23.61 
 
 		 375 aa  57  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1517  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.1 
 
 		 393 aa  57  0.0000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2082  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.2 
 
 		 379 aa  56.6  0.0000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.107005  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1494  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  22.68 
 
 		 456 aa  55.1  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.169709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1298  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.67 
 
 		 489 aa  53.1  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.53579  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0509  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  22.92 
 
 		 404 aa  52  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1554  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  21.74 
 
 		 408 aa  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.138705 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1743  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  22.43 
 
 		 402 aa  52.8  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2082  twin-arginine translocation pathway signal  21.85 
 
 		 491 aa  51.6  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13490  NADH dehydrogenase, FAD-containing subunit  31.97 
 
 		 457 aa  50.8  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.000897572  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5137  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.7 
 
 		 377 aa  50.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.318607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2576  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.12 
 
 		 404 aa  50.4  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.581088  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0523  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  20.97 
 
 		 383 aa  49.7  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.601126  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0441  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.14 
 
 		 385 aa  49.7  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4036  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  24.81 
 
 		 387 aa  48.5  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.417211  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0165  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  25.44 
 
 		 379 aa  48.5  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.934981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3707  hypothetical protein  26.22 
 
 		 563 aa  48.9  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.78076  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1203  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  21.8 
 
 		 413 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.223151  normal  0.0279723 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3442  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.22 
 
 		 563 aa  48.9  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352677  normal  0.0673657 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0868  hypothetical protein  27.05 
 
 		 539 aa  48.5  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.210326 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0432  NADH dehydrogenase  27.11 
 
 		 458 aa  48.1  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.207779  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4043  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.27 
 
 		 388 aa  47.8  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1884  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.05 
 
 		 408 aa  47.4  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0624  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  22.76 
 
 		 413 aa  47  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0441404 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0069  sulfide dehydrogenase, flavoprotein subunit, putative  20.56 
 
 		 408 aa  47  0.0008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1369  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  21.71 
 
 		 408 aa  46.2  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4075  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.27 
 
 		 388 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1127  sulfide-quinone reductase  22.47 
 
 		 408 aa  46.2  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.269645 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0353  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  22.6 
 
 		 384 aa  44.7  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2006  putative oxidoreductase  24.23 
 
 		 418 aa  45.1  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.113232  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1051  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  22.37 
 
 		 390 aa  44.7  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0223  oxidoreductase, putative  21.75 
 
 		 413 aa  45.1  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0077  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.82 
 
 		 397 aa  45.1  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0075  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.82 
 
 		 397 aa  45.1  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08346  conserved hypothetical protein  22.53 
 
 		 442 aa  44.7  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2417  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.27 
 
 		 383 aa  44.3  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.755608  normal  0.657497 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1221  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.66 
 
 		 434 aa  43.9  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2936  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.72 
 
 		 425 aa  43.9  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.373633  normal  0.792447 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0369  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.14 
 
 		 402 aa  43.9  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2915  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.75 
 
 		 399 aa  43.5  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4021  hypothetical protein  21.92 
 
 		 450 aa  43.5  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>