79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0071 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_1347  sulfide-quinone reductase, putative  82.44 
 
 
484 aa  858    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0882  sulfide-quinone reductase, putative  80.79 
 
 
484 aa  835    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.638207  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0071  sulfide-quinone reductase, putative  100 
 
 
484 aa  1008    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0619  sulfide-quinone reductase, putative  59.51 
 
 
489 aa  600  1e-170  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1163  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  46.07 
 
 
473 aa  436  1e-121  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000197587  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2428  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.21 
 
 
477 aa  392  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2405  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.49 
 
 
477 aa  377  1e-103  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0868256  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2569  sulfide-quinone reductase  40.08 
 
 
477 aa  373  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000267318  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2161  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.57 
 
 
477 aa  366  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.613284  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2046  sulfide-quinone reductase, putative  39.14 
 
 
477 aa  365  1e-99  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.972392  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2225  sulfide-quinone reductase  30.04 
 
 
422 aa  172  1e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.659871 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1170  sulfide-quinone reductase  28.76 
 
 
435 aa  168  2e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3722  sulfide-quinone reductase  29.57 
 
 
428 aa  168  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.094344  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0596  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.54 
 
 
425 aa  167  5.9999999999999996e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000167725  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1326  sulfide-quinone reductase  28.39 
 
 
427 aa  159  8e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.049484  normal  0.215717 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2831  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.73 
 
 
423 aa  159  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.697363  hitchhiker  0.00254819 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0239  sulfide-quinone reductase  28.64 
 
 
426 aa  157  3e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1570  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  29.9 
 
 
402 aa  155  1e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0254899 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4096  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.91 
 
 
430 aa  153  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.715677 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2155  sulfide-quinone reductase  27.97 
 
 
424 aa  150  5e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1792  sulfide-quinone reductase, putative  33.74 
 
 
434 aa  145  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1469  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.74 
 
 
434 aa  145  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.304083  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0055  sulfide:quinone oxidoreductase  27.12 
 
 
423 aa  144  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2289  sulfide-quinone reductase  27.77 
 
 
430 aa  143  9e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3759  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.91 
 
 
428 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3378  sulfide-quinone reductase  26.35 
 
 
429 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.252874  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4230.1  quinone reductase  28.18 
 
 
321 aa  134  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1390  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.5 
 
 
435 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0862437  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3562  sulfide-quinone reductase  27.65 
 
 
426 aa  130  6e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3245  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.44 
 
 
426 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.552628  normal  0.391539 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2448  sulfide-quinone reductase  29.63 
 
 
427 aa  127  3e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.650431  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0163  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.07 
 
 
403 aa  123  9e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.505283  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2477  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.15 
 
 
426 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3722  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.45 
 
 
434 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.860227  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2039  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.93 
 
 
432 aa  113  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0125  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.28 
 
 
428 aa  112  1.0000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000144502  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1688  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.16 
 
 
436 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00724142 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1407  sulfide-quinone reductase  23.98 
 
 
532 aa  89.7  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0077  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.41 
 
 
414 aa  73.2  0.000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2059  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.13 
 
 
409 aa  70.5  0.00000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.761901  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1494  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.31 
 
 
456 aa  64.7  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.169709  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0099  sulfide dehydrogenase, flavoprotein subunit, putative  24.74 
 
 
408 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1665  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.26 
 
 
461 aa  62.4  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1529  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.53 
 
 
389 aa  61.6  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.932731  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1517  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.64 
 
 
393 aa  58.2  0.0000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1554  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.34 
 
 
408 aa  56.2  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.138705 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1298  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  22.81 
 
 
489 aa  55.5  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.53579  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49591  predicted protein  24.68 
 
 
202 aa  54.7  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0157448  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0077  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  21.45 
 
 
397 aa  54.3  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0075  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  21.45 
 
 
397 aa  54.3  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2576  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.59 
 
 
404 aa  53.9  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.581088  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1743  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  23.37 
 
 
402 aa  53.9  0.000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0523  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  21.93 
 
 
383 aa  52.4  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.601126  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2082  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.35 
 
 
379 aa  52  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.107005  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0298  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  22.73 
 
 
382 aa  51.6  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000682999  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1051  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  21.01 
 
 
390 aa  50.1  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08346  conserved hypothetical protein  22.16 
 
 
442 aa  48.9  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0432  NADH dehydrogenase  27.74 
 
 
458 aa  48.9  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.207779  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3458  hypothetical protein  22.55 
 
 
414 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2082  twin-arginine translocation pathway signal  19.21 
 
 
491 aa  48.5  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0250  NADH dehydrogenase  24.1 
 
 
423 aa  48.1  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.399316  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3437  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  22.35 
 
 
379 aa  48.5  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000631471  normal  0.124537 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1369  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  22.26 
 
 
408 aa  47.8  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1841  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.61 
 
 
431 aa  48.1  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00431657  normal  0.309635 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0509  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  22.37 
 
 
404 aa  48.1  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10336  dehydrogenase/reductase  22.26 
 
 
388 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0065  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  24.44 
 
 
369 aa  46.6  0.0009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4021  hypothetical protein  23.47 
 
 
450 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1331  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.24 
 
 
434 aa  46.6  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.336617  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0069  sulfide dehydrogenase, flavoprotein subunit, putative  21.6 
 
 
408 aa  46.2  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3442  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.95 
 
 
563 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352677  normal  0.0673657 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0008  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.6 
 
 
451 aa  45.4  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3707  hypothetical protein  23.95 
 
 
563 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.78076  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0868  hypothetical protein  25.09 
 
 
539 aa  45.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.210326 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4036  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  23.28 
 
 
387 aa  45.8  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.417211  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1884  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  22.68 
 
 
408 aa  45.8  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2117  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.7 
 
 
428 aa  44.7  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2821  NADH dehydrogenase  24.84 
 
 
409 aa  44.3  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13490  NADH dehydrogenase, FAD-containing subunit  28.69 
 
 
457 aa  43.9  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.000897572  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>