194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2518 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2518  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  100 
 
 		 196 aa  374  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2700  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  93.37 
 
 		 196 aa  310  5.999999999999999e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143987  hitchhiker  0.0000899582 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6032  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  68.75 
 
 		 209 aa  212  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0645  precorrin-8X methylmutase  64.4 
 
 		 199 aa  204  8e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000995367  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1319  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  69.11 
 
 		 217 aa  199  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0427832  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0477  precorrin-8X methylmutase  46.57 
 
 		 214 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03744  putative transmembrane protein  45.69 
 
 		 534 aa  132  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.937216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1341  precorrin-8X methylmutase  37.23 
 
 		 210 aa  131  6e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1269  precorrin-8X methylmutase  46.15 
 
 		 214 aa  131  6.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0352716  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1298  precorrin-8X methylmutase  45.7 
 
 		 211 aa  129  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000022919  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2999  precorrin-8X methylmutase  45.1 
 
 		 213 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.540254  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0621  precorrin-8X methylmutase  42.94 
 
 		 210 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.517297  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1343  precorrin-8X methylmutase  41.42 
 
 		 212 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.212659  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2360  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  40.61 
 
 		 520 aa  127  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5593  Precorrin-8X methylmutase  45.36 
 
 		 208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179804  normal  0.278794 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1298  Precorrin-8X methylmutase  39.59 
 
 		 207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456818 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0033  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  43.9 
 
 		 213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1332  precorrin-8X methylmutase  41.42 
 
 		 212 aa  126  3e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0538013  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1287  precorrin-8X methylmutase  42.71 
 
 		 208 aa  123  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1097  precorrin-8X methylmutase  42.5 
 
 		 210 aa  122  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0308  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  35.1 
 
 		 207 aa  122  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1250  precorrin-8X methylmutase  42.21 
 
 		 208 aa  122  4e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2136  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  41.5 
 
 		 224 aa  121  6e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0350382 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0697  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  36.23 
 
 		 205 aa  120  9e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3545  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  40.2 
 
 		 214 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2555  precorrin-8X methylmutase  36.76 
 
 		 207 aa  119  1.9999999999999998e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1553  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  40 
 
 		 215 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.160219  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3611  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  40.2 
 
 		 216 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2613  Precorrin-8X methylmutase  40.21 
 
 		 215 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1898  precorrin-8X methylmutase  41.71 
 
 		 208 aa  118  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.171358  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1435  precorrin-8X methylmutase  37.76 
 
 		 209 aa  117  7.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.170002  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1241  precorrin-8X methylmutase  37.76 
 
 		 209 aa  117  7.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.189427  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0575  Precorrin-8X methylmutase  43.23 
 
 		 206 aa  117  9e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204948  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1477  precorrin-8X methylmutase  35.94 
 
 		 201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1285  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  39.29 
 
 		 211 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.808372  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0317  precorrin-8X methylmutase  41.41 
 
 		 224 aa  115  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1303  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  40.91 
 
 		 212 aa  115  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0642  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  44.55 
 
 		 222 aa  115  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1504  precorrin-8X methylmutase  35.94 
 
 		 200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1382  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  38.81 
 
 		 214 aa  113  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2706  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  40.82 
 
 		 207 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0197172  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1720  cobalt-precorrin-8X methylmutase  35.96 
 
 		 227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0015  precorrin-8X methylmutase  39.64 
 
 		 212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0567  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  43.94 
 
 		 222 aa  112  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2320  precorrin-8X methylmutase  40.72 
 
 		 209 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.415646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5060  precorrin-8X methylmutase  34.85 
 
 		 211 aa  111  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341493 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3178  precorrin-8X methylmutase  41.24 
 
 		 209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.333659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6020  precorrin-8X methylmutase  40.72 
 
 		 210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00161417  normal  0.19604 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3376  precorrin-8X methylmutase  39.59 
 
 		 221 aa  109  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.218633 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1573  precorrin-8X methylmutase  42.71 
 
 		 208 aa  109  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.377269  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1591  precorrin-8X methylmutase  41.8 
 
 		 208 aa  109  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.257981 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1008  Precorrin-8X methylmutase  33.85 
 
 		 211 aa  109  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1888  precorrin-8X methylmutase  41.3 
 
 		 209 aa  108  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7175  precorrin-8X methylmutase  39.69 
 
 		 210 aa  108  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894546  normal  0.0915035 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3509  precorrin-8X methylmutase  40.93 
 
 		 209 aa  108  6e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.400984  normal  0.540092 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17660  precorrin-8X methylmutase  42.16 
 
 		 221 aa  108  6e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0262485  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4876  precorrin-8X methylmutase  40.7 
 
 		 208 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2991  precorrin-8X methylmutase  43.5 
 
 		 208 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4416  precorrin-8X methylmutase  40.7 
 
 		 208 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.416711 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2355  precorrin-8X methylmutase  37.95 
 
 		 249 aa  107  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000155393  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0080  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  32.16 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.52758 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4823  precorrin-8X methylmutase  41.27 
 
 		 208 aa  106  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.183427 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1782  Precorrin-8X methylmutase  41.75 
 
 		 208 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.140584  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2817  precorrin-8X methylmutase  39.7 
 
 		 210 aa  106  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3117  precorrin-8X methylmutase  41.45 
 
 		 230 aa  106  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2399  precorrin-8X methylmutase  43.81 
 
 		 208 aa  105  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.154427  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1193  precorrin-8X methylmutase  41.27 
 
 		 208 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0208289  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1673  precorrin-8X methylmutase  41.27 
 
 		 208 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0355413  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2493  precorrin-8X methylmutase  45.6 
 
 		 213 aa  106  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1646  precorrin-8X methylmutase  41.27 
 
 		 208 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.996028  normal  0.344579 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1852  precorrin-8X methylmutase  39.67 
 
 		 209 aa  105  6e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.334862  normal  0.809538 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00841  putative precorrin-8X methylmutase CobH  38.42 
 
 		 211 aa  105  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0644174 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1244  precorrin-8X methylmutase  41.85 
 
 		 208 aa  104  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0926514  normal  0.29626 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4475  precorrin-3B C17-methyltransferase  35.86 
 
 		 451 aa  104  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253543  normal  0.0484497 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1269  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  41.12 
 
 		 219 aa  103  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0480  precorrin isomerase, CbiC-like  35.35 
 
 		 225 aa  103  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0152  Precorrin-8X methylmutase  40.98 
 
 		 215 aa  102  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3144  precorrin-8X methylmutase  40.74 
 
 		 212 aa  102  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3460  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  42.63 
 
 		 238 aa  101  6e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1670  precorrin-8X methylmutase  38.59 
 
 		 209 aa  101  6e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.793368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18361  putative precorrin-8X methylmutase CobH  35.68 
 
 		 207 aa  101  6e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.644911  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4572  precorrin-8X methylmutase  42.71 
 
 		 208 aa  101  7e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4884  precorrin-8X methylmutase  40.74 
 
 		 208 aa  101  8e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0927  Precorrin-8X methylmutase  41.24 
 
 		 204 aa  101  9e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000290763 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0073  putative precorrin-8X methylmutase CobH  41.33 
 
 		 215 aa  100  1e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2202  cobalt-precorrin-8X methylmutase  41.33 
 
 		 210 aa  99.8  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2866  precorrin-8X methylmutase  43.3 
 
 		 732 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0605  precorrin-8X methylmutase  39.68 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.414575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2639  precorrin isomerase  40.72 
 
 		 499 aa  100  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0523957  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4618  precorrin-8X methylmutase  40.21 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.427711 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2893  precorrin-8X methylmutase  37.31 
 
 		 220 aa  99.8  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2255  cobalt-precorrin-8X methylmutase  41.33 
 
 		 210 aa  99.4  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.463985 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4828  precorrin-8X methylmutase  40.21 
 
 		 208 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111052  normal  0.504707 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1569  precorrin-8X methylmutase  41.8 
 
 		 208 aa  99.4  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0892973 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5370  precorrin-8X methylmutase  41.3 
 
 		 208 aa  99.4  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218381  normal  0.626073 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0800  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  42.94 
 
 		 194 aa  99.4  3e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2155  cobalt-precorrin-8X methylmutase  41.33 
 
 		 210 aa  99.4  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4706  precorrin-8X methylmutase  40.21 
 
 		 208 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.735221 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2209  cobalt-precorrin-8X methylmutase  41.33 
 
 		 210 aa  99  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.185251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3134  precorrin-8X methylmutase  34.16 
 
 		 217 aa  99  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688258 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>