191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0800 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0800  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  100 
 
 		 194 aa  370  1e-102  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0575  Precorrin-8X methylmutase  47.21 
 
 		 206 aa  117  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204948  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0645  precorrin-8X methylmutase  45.93 
 
 		 199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000995367  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0317  precorrin-8X methylmutase  41.75 
 
 		 224 aa  111  5e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1888  precorrin-8X methylmutase  45.26 
 
 		 209 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5593  Precorrin-8X methylmutase  46.23 
 
 		 208 aa  104  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179804  normal  0.278794 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3178  precorrin-8X methylmutase  44.78 
 
 		 209 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.333659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1782  Precorrin-8X methylmutase  43.35 
 
 		 208 aa  103  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.140584  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3266  Precorrin-8X methylmutase  44.67 
 
 		 215 aa  102  5e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0444754 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1898  precorrin-8X methylmutase  41.58 
 
 		 208 aa  101  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.171358  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3509  precorrin-8X methylmutase  42.64 
 
 		 209 aa  101  8e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.400984  normal  0.540092 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17660  precorrin-8X methylmutase  43.63 
 
 		 221 aa  101  8e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0262485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2380  precorrin-8X methylmutase  44.28 
 
 		 209 aa  101  9e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3117  precorrin-8X methylmutase  43.43 
 
 		 230 aa  99.4  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2320  precorrin-8X methylmutase  42.29 
 
 		 209 aa  99  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.415646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2151  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  47.06 
 
 		 210 aa  98.6  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0108715  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3146  precorrin-8X methylmutase  42.79 
 
 		 210 aa  98.6  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.757727  normal  0.930234 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4876  precorrin-8X methylmutase  41.09 
 
 		 208 aa  98.2  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2493  precorrin-8X methylmutase  47.03 
 
 		 213 aa  98.2  6e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4416  precorrin-8X methylmutase  41.09 
 
 		 208 aa  98.2  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.416711 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2399  precorrin-8X methylmutase  42.86 
 
 		 208 aa  97.8  8e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.154427  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1591  precorrin-8X methylmutase  43.09 
 
 		 208 aa  97.4  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.257981 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5850  precorrin-8X methylmutase  39.3 
 
 		 209 aa  97.4  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.917792 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1569  precorrin-8X methylmutase  42.55 
 
 		 208 aa  96.7  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0892973 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0152  Precorrin-8X methylmutase  42.47 
 
 		 215 aa  95.5  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1646  precorrin-8X methylmutase  42.55 
 
 		 208 aa  95.5  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.996028  normal  0.344579 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2991  precorrin-8X methylmutase  40.8 
 
 		 208 aa  95.5  5e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1193  precorrin-8X methylmutase  42.55 
 
 		 208 aa  95.5  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0208289  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1573  precorrin-8X methylmutase  42.55 
 
 		 208 aa  95.1  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.377269  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1673  precorrin-8X methylmutase  42.55 
 
 		 208 aa  95.5  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0355413  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2534  precorrin-8X methylmutase  42.79 
 
 		 209 aa  95.1  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.474036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4823  precorrin-8X methylmutase  42.55 
 
 		 208 aa  94.7  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.183427 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1097  precorrin-8X methylmutase  38.81 
 
 		 210 aa  94.7  7e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1437  precorrin-8X methylmutase  45.27 
 
 		 210 aa  94.7  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.226548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3284  precorrin-8X methylmutase  43.72 
 
 		 211 aa  94.7  8e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.174863  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1285  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  32.83 
 
 		 211 aa  94.4  9e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.808372  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0172  precorrin-8X methylmutase  42.7 
 
 		 512 aa  94  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00890226  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1287  precorrin-8X methylmutase  40.7 
 
 		 208 aa  93.6  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6217  precorrin-8X methylmutase  44.22 
 
 		 209 aa  94  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0665101  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1434  Precorrin-8X methylmutase  44.12 
 
 		 210 aa  94  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.656935  normal  0.667092 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1469  precorrin-8X methylmutase  44.22 
 
 		 209 aa  94.4  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2440  precorrin-8X methylmutase  46.52 
 
 		 210 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.341213  normal  0.0714057 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1670  precorrin-8X methylmutase  40.53 
 
 		 209 aa  93.6  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.793368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6020  precorrin-8X methylmutase  41.09 
 
 		 210 aa  93.6  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00161417  normal  0.19604 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7175  precorrin-8X methylmutase  41.09 
 
 		 210 aa  93.6  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894546  normal  0.0915035 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1712  Precorrin-8X methylmutase  43.63 
 
 		 210 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.61701  hitchhiker  0.00790463 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2700  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  43.43 
 
 		 196 aa  92.8  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143987  hitchhiker  0.0000899582 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1625  Precorrin-8X methylmutase  39.71 
 
 		 221 aa  92.8  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.72148  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1250  precorrin-8X methylmutase  40.2 
 
 		 208 aa  92.4  4e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5370  precorrin-8X methylmutase  41.88 
 
 		 208 aa  91.7  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218381  normal  0.626073 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2212  precorrin-8X methylmutase  40.89 
 
 		 209 aa  92  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0340  precorrin-8X methylmutase  43.43 
 
 		 209 aa  91.7  6e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0480  precorrin isomerase, CbiC-like  33.01 
 
 		 225 aa  91.3  7e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2817  precorrin-8X methylmutase  41.79 
 
 		 210 aa  91.3  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1520  precorrin-8X methylmutase  42.51 
 
 		 219 aa  91.3  8e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2249  precorrin-8X methylmutase  42.93 
 
 		 208 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.668584  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2706  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  37.5 
 
 		 207 aa  90.9  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0197172  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1519  precorrin-8X methylmutase  43.72 
 
 		 209 aa  90.9  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.197163  normal  0.023292 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4572  precorrin-8X methylmutase  41.58 
 
 		 208 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2639  precorrin isomerase  41.41 
 
 		 499 aa  90.5  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0523957  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0477  precorrin-8X methylmutase  37.93 
 
 		 214 aa  90.1  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1244  precorrin-8X methylmutase  41.36 
 
 		 208 aa  89.7  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0926514  normal  0.29626 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2893  precorrin-8X methylmutase  34.91 
 
 		 220 aa  90.1  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3144  precorrin-8X methylmutase  41.36 
 
 		 212 aa  89.7  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1162  precorrin-8X methylmutase  42.02 
 
 		 208 aa  89.4  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00824413  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1603  precorrin-8X methylmutase  42.02 
 
 		 208 aa  89.4  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0559116  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0265  precorrin-8X methylmutase  42.02 
 
 		 208 aa  89.4  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.187916  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0895  precorrin-8X methylmutase  42.02 
 
 		 208 aa  89.4  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.182747  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2999  precorrin-8X methylmutase  38.16 
 
 		 213 aa  89  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.540254  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1435  precorrin-8X methylmutase  33.33 
 
 		 209 aa  89  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.170002  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1241  precorrin-8X methylmutase  33.33 
 
 		 209 aa  89  4e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.189427  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0697  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  32.76 
 
 		 205 aa  89  4e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1269  precorrin-8X methylmutase  38.5 
 
 		 214 aa  88.6  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0352716  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26500  precorrin-8X methylmutase  42.41 
 
 		 208 aa  88.6  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00589849  normal  0.995121 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0308  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  32.82 
 
 		 207 aa  88.2  7e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3430  precorrin-8X methylmutase  40.64 
 
 		 208 aa  88.2  7e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193703  normal  0.583558 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2355  precorrin-8X methylmutase  33.53 
 
 		 249 aa  87.8  8e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000155393  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2191  Precorrin-8X methylmutase  41.58 
 
 		 211 aa  87.8  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2112  precorrin-8X methylmutase  41.88 
 
 		 208 aa  87.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.937061  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0605  precorrin-8X methylmutase  38.83 
 
 		 208 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.414575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5691  Precorrin-8X methylmutase  41.71 
 
 		 210 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1949  precorrin-8X methylmutase  41.88 
 
 		 208 aa  87.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0695491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1966  precorrin-8X methylmutase  41.88 
 
 		 208 aa  87.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.000701969  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2929  precorrin-8X methylmutase  40.4 
 
 		 209 aa  86.7  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.451647  hitchhiker  0.00280569 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2488  precorrin-8X methylmutase  42.25 
 
 		 208 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2136  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  37.86 
 
 		 224 aa  86.3  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0350382 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2533  precorrin-8X methylmutase  42.25 
 
 		 208 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.466209  normal  0.41387 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2525  precorrin-8X methylmutase  42.25 
 
 		 208 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.345603  normal  0.182328 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1319  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  39.55 
 
 		 217 aa  86.7  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0427832  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5060  precorrin-8X methylmutase  31.03 
 
 		 211 aa  85.9  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341493 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0027  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  37.56 
 
 		 230 aa  85.9  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.615155  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12101  precorrin-8X methylmutase  42.78 
 
 		 208 aa  85.5  5e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0138483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1852  precorrin-8X methylmutase  37.37 
 
 		 209 aa  84.7  7e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.334862  normal  0.809538 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4884  precorrin-8X methylmutase  40.96 
 
 		 208 aa  84.7  8e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1008  Precorrin-8X methylmutase  31.09 
 
 		 211 aa  84.3  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4618  precorrin-8X methylmutase  39.89 
 
 		 208 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.427711 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1477  precorrin-8X methylmutase  31.28 
 
 		 201 aa  83.2  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1341  precorrin-8X methylmutase  29.02 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0342  precorrin-8X methylmutase  36.76 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.470855  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21130  precorrin-8X methylmutase  35.55 
 
 		 219 aa  82.8  0.000000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>