More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0699 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_0699  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
298 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.971561 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.65 
 
 
318 aa  263  3e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0284  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  50.38 
 
 
292 aa  255  7e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.466037 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0591  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.51 
 
 
307 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0783  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.18 
 
 
295 aa  227  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0828  ABC-type phosphate transport system, permease component  43.75 
 
 
294 aa  218  7.999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000218863  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2841  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.54 
 
 
295 aa  196  3e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0777991  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1570  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.14 
 
 
288 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0349  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.78 
 
 
288 aa  163  3e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000182732 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0487  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.16 
 
 
288 aa  160  3e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0422  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36 
 
 
295 aa  149  5e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0571  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  33.09 
 
 
289 aa  144  2e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0126  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.29 
 
 
279 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1117  hypothetical protein  35.42 
 
 
627 aa  125  9e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1918  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.67 
 
 
604 aa  119  6e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.396887  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2297  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.15 
 
 
279 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2277  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  35.79 
 
 
646 aa  117  3e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1060  phosphate ABC transporter permease  34.98 
 
 
297 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2741  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  33.21 
 
 
281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2982  phosphate ABC transporter permease  32.74 
 
 
649 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4408  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  32.61 
 
 
280 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0197285  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0481  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  34.56 
 
 
645 aa  108  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0750  ABC phosphate transporter, inner membrane subunit  34.41 
 
 
286 aa  107  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000021979  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0570  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  34.62 
 
 
292 aa  107  3e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1827  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.87 
 
 
270 aa  106  4e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2418  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  31.87 
 
 
940 aa  106  5e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.420057  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1509  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  30.36 
 
 
276 aa  106  6e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21560  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.28 
 
 
284 aa  105  8e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0421  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  29.08 
 
 
290 aa  105  9e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2104  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  29.08 
 
 
282 aa  105  9e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0763  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  32.38 
 
 
309 aa  104  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.763641  normal  0.179278 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1558  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  32.02 
 
 
276 aa  102  6e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1163  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  31.86 
 
 
280 aa  102  9e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0093  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.02 
 
 
284 aa  102  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0751  phosphate ABC transporter inner membrane protein  34.47 
 
 
297 aa  101  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0108561  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2547  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.88 
 
 
346 aa  101  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.128855 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2590  ABC phosphate transporter inner membrane protein PstA  31.56 
 
 
281 aa  101  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00589787  normal  0.413693 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4150  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  30.57 
 
 
340 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.28828  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0488  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  32.09 
 
 
291 aa  100  4e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.456942  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4078  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  30.45 
 
 
293 aa  99.8  5e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1779  phosphate ABC transporter, permease protein  32.31 
 
 
296 aa  99.8  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2120  phosphate ABC transporter, permease protein  31.58 
 
 
284 aa  99.8  5e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4415  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  33.96 
 
 
570 aa  99.4  7e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0704042  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2105  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  30.38 
 
 
283 aa  98.2  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4172  phosphate ABC transporter permease  30.51 
 
 
288 aa  98.6  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4494  phosphate ABC transporter permease  30.51 
 
 
288 aa  98.6  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2442  phosphate ABC transporter permease  34.3 
 
 
303 aa  98.6  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.666961  hitchhiker  0.00775863 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2102  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  27.8 
 
 
284 aa  98.6  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4494  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  32.65 
 
 
312 aa  98.2  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2888  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.4 
 
 
288 aa  98.6  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.107723 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1927  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  33.62 
 
 
294 aa  98.6  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0747671  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4010  phosphate ABC transporter, permease  30.51 
 
 
288 aa  98.2  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4020  phosphate ABC transporter, permease  30.51 
 
 
288 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0582  phosphate ABC transporter permease  29.89 
 
 
277 aa  97.8  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4290  phosphate ABC transporter, permease protein  30.08 
 
 
288 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00559042 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1958  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  33.33 
 
 
287 aa  97.8  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0348  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  31.63 
 
 
291 aa  97.8  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1827  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  33.33 
 
 
297 aa  97.8  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.944674  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001264  phosphate transport system permease protein PstA  29.65 
 
 
287 aa  97.4  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1571  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  32.09 
 
 
291 aa  97.1  3e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4350  phosphate ABC transporter, permease protein  30.51 
 
 
288 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4403  phosphate ABC transporter, permease protein  30.51 
 
 
288 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05139  molybdate ABC transporter permease protein  29.65 
 
 
287 aa  96.7  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1162  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  29.46 
 
 
284 aa  96.7  4e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0620  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  32.18 
 
 
274 aa  96.7  4e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.363148  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1930  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  31.3 
 
 
282 aa  96.7  4e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.19172  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1791  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  32.34 
 
 
565 aa  96.7  5e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0380745 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0652  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.57 
 
 
290 aa  96.3  6e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.180662 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1448  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  28.63 
 
 
305 aa  95.9  7e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1477  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  28.63 
 
 
305 aa  95.9  7e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.508211  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0606  phosphate ABC transporter, permease protein  31.42 
 
 
274 aa  95.9  7e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.32336  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21615  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  30.42 
 
 
318 aa  95.1  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2520  phosphate ABC transporter inner membrane subunit PstA  32.24 
 
 
276 aa  95.5  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.272992 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1699  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  32.53 
 
 
550 aa  95.1  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.934676 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4514  phosphate ABC transporter permease  34.3 
 
 
293 aa  94.4  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1358  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  31.73 
 
 
553 aa  94.4  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.221857  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0067  phosphate ABC transporter, permease protein  29.52 
 
 
289 aa  94  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.191661  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1502  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  31.33 
 
 
550 aa  93.6  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0125389  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3641  phosphate ABC transporter, permease protein  32.93 
 
 
545 aa  93.6  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1409  phosphate ABC transporter, permease protein, putative  32.53 
 
 
550 aa  93.6  4e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.650343  normal  0.0594948 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1669  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  30.41 
 
 
278 aa  92.8  5e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000331352  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2583  phosphate ABC transporter permease  32.13 
 
 
552 aa  93.2  5e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.129477  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0660  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.67 
 
 
354 aa  92.8  6e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000330308 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3167  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  30.92 
 
 
550 aa  92.4  8e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1780  phosphate ABC transporter, permease protein  31.41 
 
 
307 aa  92.4  8e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_148  phosphate ABC transporter, permease protein  33.83 
 
 
283 aa  92.4  8e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4290  phosphate ABC transporter, permease protein  29.07 
 
 
278 aa  92.4  9e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0482  phosphate ABC transporter inner membrane subunit PstA  31.47 
 
 
310 aa  91.7  1e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3424  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  33.48 
 
 
309 aa  91.7  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2744  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  30.92 
 
 
550 aa  92  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0855633  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2998  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  27.9 
 
 
288 aa  91.7  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4123  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  28.17 
 
 
288 aa  91.7  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3159  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.23 
 
 
532 aa  92  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1435  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  30.92 
 
 
552 aa  92  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0504  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  31.33 
 
 
588 aa  91.3  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.569683  normal  0.415614 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0565  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  28.76 
 
 
296 aa  91.3  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0134721  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0657  ABC-type phosphate transport system, permease component  37.5 
 
 
532 aa  91.3  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.667392  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4004  ABC phosphate transporter, inner membrane subunit  33.2 
 
 
304 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.757198  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4386  phosphate ABC transporter, permease protein  28.64 
 
 
288 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.446606  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0850  phosphate ABC transporter, permease protein  28.64 
 
 
288 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>