28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0513 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0513  cytochrome c, putative  100 
 
 		 308 aa  638    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0882  cytochrome c, putative  38.67 
 
 		 274 aa  176  5e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.396055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0759  cytochrome c, putative  38.85 
 
 		 273 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0884  cytochrome c, putative  37.06 
 
 		 273 aa  171  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3437  cytochrome c, putative  39.53 
 
 		 273 aa  171  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3633  cytochrome c, putative  38.64 
 
 		 273 aa  163  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2750  cytochrome c, putative  38.44 
 
 		 272 aa  161  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0879  cytochrome c, putative  37.04 
 
 		 273 aa  160  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.108597  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3344  cytochrome c, putative  37.42 
 
 		 274 aa  159  4e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0939  cytochrome c, putative  37.17 
 
 		 274 aa  159  7e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3241  cytochrome c, putative  37.09 
 
 		 274 aa  158  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0782  cytochrome c, putative  37.09 
 
 		 274 aa  158  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0690  hypothetical protein  31.47 
 
 		 286 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0691  hypothetical protein  31.87 
 
 		 286 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.182936  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0656  hypothetical protein  30.13 
 
 		 286 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0318  split soret cytochrome c precursor  30.58 
 
 		 259 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0329  split soret cytochrome c precursor  31.36 
 
 		 259 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2483  hypothetical protein  30.56 
 
 		 293 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.166117  normal  0.120833 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0340  split soret cytochrome c precursor  30.93 
 
 		 259 aa  99  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3269  chain A, iron Centre cytochrome c protein  32.29 
 
 		 281 aa  98.6  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2150  split soret cytochrome c precursor  30.54 
 
 		 279 aa  96.3  6e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3211  split soret cytochrome c precursor  32.19 
 
 		 281 aa  94.7  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0305  split soret cytochrome c precursor  30.9 
 
 		 282 aa  92  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.463499 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2268  hypothetical protein  31.7 
 
 		 281 aa  90.1  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2360  split soret cytochrome c precursor  29.36 
 
 		 283 aa  82.8  0.000000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03810  split soret cytochrome c precursor  25.42 
 
 		 249 aa  78.2  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3017  split soret cytochrome c precursor  25.6 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0361  decaheme cytochrome c MtrA  32.32 
 
 		 286 aa  43.5  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162857  hitchhiker  0.000223849 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>