27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3633 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3633  cytochrome c, putative  100 
 
 		 273 aa  559  1e-158  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3437  cytochrome c, putative  86.45 
 
 		 273 aa  493  1e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0759  cytochrome c, putative  79.12 
 
 		 273 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0884  cytochrome c, putative  75.82 
 
 		 273 aa  442  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0782  cytochrome c, putative  76.56 
 
 		 274 aa  434  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3241  cytochrome c, putative  76.92 
 
 		 274 aa  435  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3344  cytochrome c, putative  76.56 
 
 		 274 aa  434  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0882  cytochrome c, putative  74.45 
 
 		 274 aa  429  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.396055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0879  cytochrome c, putative  74.73 
 
 		 273 aa  425  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.108597  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0939  cytochrome c, putative  73.99 
 
 		 274 aa  421  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2750  cytochrome c, putative  73.99 
 
 		 272 aa  401  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0513  cytochrome c, putative  38.64 
 
 		 308 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0340  split soret cytochrome c precursor  36.16 
 
 		 259 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0329  split soret cytochrome c precursor  35.71 
 
 		 259 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0318  split soret cytochrome c precursor  35.71 
 
 		 259 aa  99  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3211  split soret cytochrome c precursor  30.28 
 
 		 281 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0305  split soret cytochrome c precursor  30 
 
 		 282 aa  94.4  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.463499 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03810  split soret cytochrome c precursor  30.14 
 
 		 249 aa  91.3  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0656  hypothetical protein  30.77 
 
 		 286 aa  85.5  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2483  hypothetical protein  29.89 
 
 		 293 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.166117  normal  0.120833 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0690  hypothetical protein  29.41 
 
 		 286 aa  83.2  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0691  hypothetical protein  28.15 
 
 		 286 aa  82  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.182936  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3017  split soret cytochrome c precursor  28.21 
 
 		 261 aa  75.1  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2150  split soret cytochrome c precursor  28.06 
 
 		 279 aa  71.6  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3269  chain A, iron Centre cytochrome c protein  30.6 
 
 		 281 aa  68.9  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2268  hypothetical protein  26.55 
 
 		 281 aa  67.4  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2360  split soret cytochrome c precursor  27.41 
 
 		 283 aa  67  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>