27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2360 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2360  split soret cytochrome c precursor  100 
 
 		 283 aa  588  1e-167  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3269  chain A, iron Centre cytochrome c protein  40 
 
 		 281 aa  171  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03810  split soret cytochrome c precursor  39.78 
 
 		 249 aa  154  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0340  split soret cytochrome c precursor  37.73 
 
 		 259 aa  143  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0329  split soret cytochrome c precursor  37.73 
 
 		 259 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3211  split soret cytochrome c precursor  34.29 
 
 		 281 aa  139  7e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0318  split soret cytochrome c precursor  37.73 
 
 		 259 aa  139  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0690  hypothetical protein  34.09 
 
 		 286 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2268  hypothetical protein  32.38 
 
 		 281 aa  137  3.0000000000000003e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0691  hypothetical protein  34.53 
 
 		 286 aa  135  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.182936  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2483  hypothetical protein  36.02 
 
 		 293 aa  133  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.166117  normal  0.120833 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0656  hypothetical protein  30.39 
 
 		 286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2150  split soret cytochrome c precursor  33.47 
 
 		 279 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0305  split soret cytochrome c precursor  37.2 
 
 		 282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.463499 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3017  split soret cytochrome c precursor  31.77 
 
 		 261 aa  113  3e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0882  cytochrome c, putative  27.17 
 
 		 274 aa  100  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.396055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0884  cytochrome c, putative  29.24 
 
 		 273 aa  96.3  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0513  cytochrome c, putative  28.45 
 
 		 308 aa  95.9  7e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0759  cytochrome c, putative  28.67 
 
 		 273 aa  94.4  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3437  cytochrome c, putative  27.17 
 
 		 273 aa  92  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3633  cytochrome c, putative  28.37 
 
 		 273 aa  89.4  6e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0939  cytochrome c, putative  27.24 
 
 		 274 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0879  cytochrome c, putative  26.35 
 
 		 273 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.108597  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0782  cytochrome c, putative  27.6 
 
 		 274 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3344  cytochrome c, putative  27.24 
 
 		 274 aa  82  0.000000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3241  cytochrome c, putative  27.24 
 
 		 274 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2750  cytochrome c, putative  27.27 
 
 		 272 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>