27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3211 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_3211  split soret cytochrome c precursor  100 
 
 
281 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0305  split soret cytochrome c precursor  65.6 
 
 
282 aa  395  1e-109  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.463499 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2150  split soret cytochrome c precursor  58.14 
 
 
279 aa  308  5e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3017  split soret cytochrome c precursor  50.18 
 
 
261 aa  267  2e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3269  chain A, iron Centre cytochrome c protein  38.77 
 
 
281 aa  163  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0340  split soret cytochrome c precursor  41.82 
 
 
259 aa  152  8e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0691  hypothetical protein  33.45 
 
 
286 aa  149  5e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.182936  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03810  split soret cytochrome c precursor  36.26 
 
 
249 aa  148  8e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0690  hypothetical protein  33.11 
 
 
286 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0329  split soret cytochrome c precursor  40.91 
 
 
259 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2268  hypothetical protein  33.09 
 
 
281 aa  146  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0318  split soret cytochrome c precursor  40.53 
 
 
259 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0656  hypothetical protein  31.53 
 
 
286 aa  139  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2360  split soret cytochrome c precursor  36.8 
 
 
283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2483  hypothetical protein  31.38 
 
 
293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.166117  normal  0.120833 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0882  cytochrome c, putative  29.93 
 
 
274 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.396055  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3437  cytochrome c, putative  31.8 
 
 
273 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0884  cytochrome c, putative  31.1 
 
 
273 aa  105  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0939  cytochrome c, putative  29.97 
 
 
274 aa  104  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0879  cytochrome c, putative  29.58 
 
 
273 aa  102  5e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.108597  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3344  cytochrome c, putative  29.27 
 
 
274 aa  99.8  5e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3241  cytochrome c, putative  29.27 
 
 
274 aa  99.4  6e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0782  cytochrome c, putative  29.27 
 
 
274 aa  99.4  6e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0759  cytochrome c, putative  30.88 
 
 
273 aa  99.4  7e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2750  cytochrome c, putative  30.28 
 
 
272 aa  98.6  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0513  cytochrome c, putative  29.97 
 
 
308 aa  96.7  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3633  cytochrome c, putative  30.28 
 
 
273 aa  96.3  5e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>