27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_3017 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_3017  split soret cytochrome c precursor  100 
 
 
261 aa  543  1e-153  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3211  split soret cytochrome c precursor  50.18 
 
 
281 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0305  split soret cytochrome c precursor  49.29 
 
 
282 aa  249  2e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.463499 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2150  split soret cytochrome c precursor  51.53 
 
 
279 aa  235  6e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0329  split soret cytochrome c precursor  38.97 
 
 
259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0340  split soret cytochrome c precursor  38.03 
 
 
259 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3269  chain A, iron Centre cytochrome c protein  34.18 
 
 
281 aa  133  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0318  split soret cytochrome c precursor  38.5 
 
 
259 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0691  hypothetical protein  30.61 
 
 
286 aa  126  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.182936  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0690  hypothetical protein  30.27 
 
 
286 aa  125  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0656  hypothetical protein  32.34 
 
 
286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2483  hypothetical protein  29.27 
 
 
293 aa  115  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.166117  normal  0.120833 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03810  split soret cytochrome c precursor  29.46 
 
 
249 aa  115  8.999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2268  hypothetical protein  31.27 
 
 
281 aa  108  7.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2360  split soret cytochrome c precursor  31.58 
 
 
283 aa  100  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0882  cytochrome c, putative  29.29 
 
 
274 aa  96.3  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.396055  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0879  cytochrome c, putative  27.14 
 
 
273 aa  88.2  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.108597  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0939  cytochrome c, putative  27.66 
 
 
274 aa  87.8  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3437  cytochrome c, putative  29.58 
 
 
273 aa  86.3  5e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3344  cytochrome c, putative  28.07 
 
 
274 aa  86.3  5e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3241  cytochrome c, putative  28.07 
 
 
274 aa  85.9  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0782  cytochrome c, putative  28.07 
 
 
274 aa  85.9  6e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0884  cytochrome c, putative  27.21 
 
 
273 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0759  cytochrome c, putative  28.17 
 
 
273 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3633  cytochrome c, putative  28.21 
 
 
273 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2750  cytochrome c, putative  26.24 
 
 
272 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0513  cytochrome c, putative  25.6 
 
 
308 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>