27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3269 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3269  chain A, iron Centre cytochrome c protein  100 
 
 
281 aa  586  1e-166  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0340  split soret cytochrome c precursor  41.67 
 
 
259 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0318  split soret cytochrome c precursor  42.59 
 
 
259 aa  170  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2360  split soret cytochrome c precursor  39.3 
 
 
283 aa  169  4e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3211  split soret cytochrome c precursor  39.7 
 
 
281 aa  169  7e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0329  split soret cytochrome c precursor  41.67 
 
 
259 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0305  split soret cytochrome c precursor  38.6 
 
 
282 aa  158  1e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.463499 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03810  split soret cytochrome c precursor  41.04 
 
 
249 aa  152  4e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2268  hypothetical protein  37.09 
 
 
281 aa  151  1e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3017  split soret cytochrome c precursor  34.18 
 
 
261 aa  142  5e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0691  hypothetical protein  31.91 
 
 
286 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.182936  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2150  split soret cytochrome c precursor  37.07 
 
 
279 aa  140  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0690  hypothetical protein  32.04 
 
 
286 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0656  hypothetical protein  30.88 
 
 
286 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2483  hypothetical protein  32.75 
 
 
293 aa  126  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.166117  normal  0.120833 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0513  cytochrome c, putative  32.29 
 
 
308 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0939  cytochrome c, putative  31.32 
 
 
274 aa  100  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3241  cytochrome c, putative  31.32 
 
 
274 aa  95.5  9e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3344  cytochrome c, putative  31.32 
 
 
274 aa  95.1  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0782  cytochrome c, putative  31.32 
 
 
274 aa  95.1  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0879  cytochrome c, putative  30.82 
 
 
273 aa  94  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.108597  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0884  cytochrome c, putative  30.22 
 
 
273 aa  93.2  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3437  cytochrome c, putative  30.36 
 
 
273 aa  93.2  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0882  cytochrome c, putative  28.57 
 
 
274 aa  88.2  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.396055  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0759  cytochrome c, putative  31.56 
 
 
273 aa  85.9  7e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3633  cytochrome c, putative  30.6 
 
 
273 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2750  cytochrome c, putative  30.5 
 
 
272 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>