27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0939 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0939  cytochrome c, putative  100 
 
 		 274 aa  566  1e-160  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3241  cytochrome c, putative  94.89 
 
 		 274 aa  544  1e-154  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3344  cytochrome c, putative  94.53 
 
 		 274 aa  544  1e-154  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0782  cytochrome c, putative  94.53 
 
 		 274 aa  543  1e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0879  cytochrome c, putative  88.64 
 
 		 273 aa  508  1e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.108597  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0884  cytochrome c, putative  78.75 
 
 		 273 aa  455  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0759  cytochrome c, putative  78.75 
 
 		 273 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3437  cytochrome c, putative  75.82 
 
 		 273 aa  436  1e-121  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2750  cytochrome c, putative  78.75 
 
 		 272 aa  429  1e-119  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0882  cytochrome c, putative  75.18 
 
 		 274 aa  429  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.396055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3633  cytochrome c, putative  73.99 
 
 		 273 aa  421  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0513  cytochrome c, putative  37.17 
 
 		 308 aa  159  6e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3211  split soret cytochrome c precursor  29.62 
 
 		 281 aa  101  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0329  split soret cytochrome c precursor  32.6 
 
 		 259 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0318  split soret cytochrome c precursor  32.16 
 
 		 259 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0340  split soret cytochrome c precursor  32.16 
 
 		 259 aa  97.1  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0690  hypothetical protein  30.87 
 
 		 286 aa  96.3  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0691  hypothetical protein  30.27 
 
 		 286 aa  96.7  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.182936  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0305  split soret cytochrome c precursor  27.68 
 
 		 282 aa  88.6  9e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.463499 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3017  split soret cytochrome c precursor  27.66 
 
 		 261 aa  87.8  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2150  split soret cytochrome c precursor  29.47 
 
 		 279 aa  87.4  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03810  split soret cytochrome c precursor  27.64 
 
 		 249 aa  87.4  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3269  chain A, iron Centre cytochrome c protein  31.32 
 
 		 281 aa  85.9  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2483  hypothetical protein  27.56 
 
 		 293 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.166117  normal  0.120833 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0656  hypothetical protein  30.34 
 
 		 286 aa  82  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2268  hypothetical protein  24.04 
 
 		 281 aa  64.3  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2360  split soret cytochrome c precursor  26.17 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>