27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0305 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0305  split soret cytochrome c precursor  100 
 
 
282 aa  585  1e-166  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.463499 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3211  split soret cytochrome c precursor  65.6 
 
 
281 aa  391  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2150  split soret cytochrome c precursor  59.34 
 
 
279 aa  296  4e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3017  split soret cytochrome c precursor  49.29 
 
 
261 aa  249  3e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3269  chain A, iron Centre cytochrome c protein  38.6 
 
 
281 aa  148  9e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0340  split soret cytochrome c precursor  42.52 
 
 
259 aa  142  8e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0329  split soret cytochrome c precursor  41.59 
 
 
259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03810  split soret cytochrome c precursor  33.21 
 
 
249 aa  135  6.0000000000000005e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0318  split soret cytochrome c precursor  41.59 
 
 
259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0691  hypothetical protein  30.51 
 
 
286 aa  125  9e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.182936  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2360  split soret cytochrome c precursor  37.2 
 
 
283 aa  123  3e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0690  hypothetical protein  30.17 
 
 
286 aa  122  5e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2268  hypothetical protein  29.71 
 
 
281 aa  122  6e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2483  hypothetical protein  34.54 
 
 
293 aa  118  9e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.166117  normal  0.120833 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0656  hypothetical protein  29.77 
 
 
286 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0879  cytochrome c, putative  28.62 
 
 
273 aa  97.1  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.108597  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3437  cytochrome c, putative  29.41 
 
 
273 aa  96.3  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0884  cytochrome c, putative  28.67 
 
 
273 aa  95.9  6e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3241  cytochrome c, putative  29.55 
 
 
274 aa  95.5  8e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3344  cytochrome c, putative  29.55 
 
 
274 aa  95.5  9e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0782  cytochrome c, putative  29.55 
 
 
274 aa  95.5  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3633  cytochrome c, putative  30 
 
 
273 aa  94.4  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0882  cytochrome c, putative  28.62 
 
 
274 aa  92.8  6e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.396055  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0513  cytochrome c, putative  30.9 
 
 
308 aa  92  9e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0759  cytochrome c, putative  29.02 
 
 
273 aa  89.7  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0939  cytochrome c, putative  27.68 
 
 
274 aa  88.6  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2750  cytochrome c, putative  28.07 
 
 
272 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>