27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0882 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0882  cytochrome c, putative  100 
 
 		 274 aa  567  1e-161  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.396055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0759  cytochrome c, putative  84.31 
 
 		 273 aa  478  1e-134  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0884  cytochrome c, putative  77.74 
 
 		 273 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3437  cytochrome c, putative  77.74 
 
 		 273 aa  447  1e-125  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3241  cytochrome c, putative  76.28 
 
 		 274 aa  431  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0939  cytochrome c, putative  75.18 
 
 		 274 aa  429  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0782  cytochrome c, putative  75.91 
 
 		 274 aa  430  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3633  cytochrome c, putative  74.45 
 
 		 273 aa  429  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3344  cytochrome c, putative  75.91 
 
 		 274 aa  430  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0879  cytochrome c, putative  72.26 
 
 		 273 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.108597  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2750  cytochrome c, putative  75.18 
 
 		 272 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0513  cytochrome c, putative  38.67 
 
 		 308 aa  176  4e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0329  split soret cytochrome c precursor  33.33 
 
 		 259 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0318  split soret cytochrome c precursor  33.33 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0340  split soret cytochrome c precursor  33.33 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3211  split soret cytochrome c precursor  29.68 
 
 		 281 aa  105  7e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0690  hypothetical protein  32.34 
 
 		 286 aa  99  8e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0691  hypothetical protein  32.05 
 
 		 286 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.182936  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3017  split soret cytochrome c precursor  29.29 
 
 		 261 aa  96.3  5e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0305  split soret cytochrome c precursor  28.62 
 
 		 282 aa  92.8  5e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.463499 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0656  hypothetical protein  29.35 
 
 		 286 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2150  split soret cytochrome c precursor  27.15 
 
 		 279 aa  89.7  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03810  split soret cytochrome c precursor  29.6 
 
 		 249 aa  90.1  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2483  hypothetical protein  29.41 
 
 		 293 aa  89  7e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.166117  normal  0.120833 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2360  split soret cytochrome c precursor  26.48 
 
 		 283 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3269  chain A, iron Centre cytochrome c protein  28.57 
 
 		 281 aa  73.2  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2268  hypothetical protein  24.22 
 
 		 281 aa  72  0.000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>