297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1543 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1543  hypothetical protein  100 
 
 
572 aa  1102    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.100753  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1079  serine/threonine protein kinase  38.27 
 
 
422 aa  94.4  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.197837  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2236  serine/threonine protein kinase  36.19 
 
 
632 aa  93.2  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129729  normal  0.143063 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0852  protein kinase  38.22 
 
 
621 aa  93.2  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0798  serine/threonine protein kinase  38.22 
 
 
638 aa  92.8  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000182668 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3083  serine/threonine protein kinase  37.72 
 
 
461 aa  92.4  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2410  serine/threonine protein kinase  38.32 
 
 
460 aa  92  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.378864  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5882  serine/threonine protein kinase  37.7 
 
 
296 aa  90.9  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0086799  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8510  Serine/threonine protein kinase-like protein  35.39 
 
 
596 aa  89.7  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1813  serine/threonine protein kinase  36.84 
 
 
411 aa  87.4  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1423  serine/threonine protein kinase  34.88 
 
 
776 aa  86.3  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.806677 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0129  serine/threonine protein kinase  35.76 
 
 
345 aa  86.3  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6676  Serine/threonine protein kinase-like protein  33.5 
 
 
678 aa  85.5  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520926  normal  0.364825 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8509  protein kinase  38.32 
 
 
377 aa  85.1  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355272  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2845  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  34.81 
 
 
562 aa  84.3  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.985984  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0775  serine/threonine protein kinase  36.52 
 
 
659 aa  84  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.37143 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3516  serine/threonine protein kinase  37.84 
 
 
481 aa  83.2  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2889  Serine/threonine protein kinase-like protein  37.04 
 
 
668 aa  82.8  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.888363  normal  0.315784 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3084  serine/threonine protein kinase  35.19 
 
 
766 aa  82.8  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0406  serine/threonine protein kinase  34.57 
 
 
418 aa  81.3  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1248  serine/threonine protein kinase  34.83 
 
 
543 aa  80.1  0.00000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.987546  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1542  Serine/threonine protein kinase-like protein  37.79 
 
 
521 aa  79  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.141681  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2361  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  34.57 
 
 
419 aa  78.6  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0831  protein kinase  35.47 
 
 
675 aa  78.6  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.060355 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6592  serine/threonine protein kinase  36.77 
 
 
468 aa  78.6  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.700225  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2884  serine/threonine protein kinase  33.95 
 
 
525 aa  77.8  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.824247 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1544  Serine/threonine protein kinase-like protein  34.03 
 
 
532 aa  77.4  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.372452  normal  0.854726 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2411  serine/threonine protein kinase  38.59 
 
 
507 aa  76.3  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.380657  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4028  serine/threonine protein kinase  39.47 
 
 
493 aa  76.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0137121  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3967  serine/threonine protein kinase  34.39 
 
 
468 aa  76.3  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1619  serine/threonine protein kinase  35.06 
 
 
703 aa  76.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.682192  normal  0.0463489 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0359  serine/threonine protein kinase  32.48 
 
 
631 aa  75.5  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0682  serine/threonine protein kinase  33.87 
 
 
674 aa  75.5  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.239095  normal  0.045288 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8906  serine/threonine protein kinase  31.35 
 
 
525 aa  75.1  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6454  serine/threonine protein kinase  36.14 
 
 
705 aa  74.3  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00864828 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25260  protein kinase family protein  31.35 
 
 
501 aa  73.9  0.000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.981301 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1541  hypothetical protein  34.64 
 
 
443 aa  71.6  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.907452  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4419  serine/threonine protein kinase  31.21 
 
 
563 aa  71.2  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4747  serine/threonine protein kinase  34.94 
 
 
470 aa  70.5  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4070  serine/threonine protein kinase  32.32 
 
 
673 aa  70.1  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00170756  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5900  serine/threonine protein kinase  34.23 
 
 
476 aa  69.7  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.377642  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3968  serine/threonine protein kinase  32.48 
 
 
528 aa  68.9  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5881  serine/threonine protein kinase  31.65 
 
 
264 aa  69.3  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00553777  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5809  serine/threonine protein kinase  35 
 
 
487 aa  68.2  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6420  serine/threonine protein kinase  32.34 
 
 
605 aa  68.2  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1863  serine/threonine protein kinase  32.89 
 
 
450 aa  68.2  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.03755  normal  0.81894 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5936  serine/threonine protein kinase  28.18 
 
 
1029 aa  67.8  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0192244 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7153  Serine/threonine protein kinase-like protein  32.32 
 
 
531 aa  67.4  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.917924  normal  0.0136035 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7418  serine/threonine protein kinase  30.14 
 
 
543 aa  67.4  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.125442  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1643  serine/threonine protein kinase  37.5 
 
 
534 aa  67  0.0000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0994433  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1316  serine/threonine protein kinase  35.8 
 
 
503 aa  66.6  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0472  serine/threonine protein kinase  30.26 
 
 
554 aa  65.9  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3969  serine/threonine protein kinase  36.67 
 
 
575 aa  65.1  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0916  serine/threonine protein kinase  30.27 
 
 
385 aa  64.3  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4798  Serine/threonine protein kinase-like protein  29.45 
 
 
446 aa  63.9  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263981  normal  0.132611 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13097  serine/threonine-protein kinase transcriptional regulatory protein pknK  33.56 
 
 
1110 aa  63.9  0.000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7753  Serine/threonine protein kinase-like protein  31.09 
 
 
512 aa  63.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0774  serine/threonine protein kinase  34.71 
 
 
595 aa  63.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1354  serine/threonine protein kinase  32.8 
 
 
535 aa  62.4  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.153882  normal  0.839237 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4174  serine/threonine protein kinase  29.53 
 
 
493 aa  62.4  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0993859  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0500  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  27.91 
 
 
490 aa  62  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2134  serine/threonine protein kinase  29.65 
 
 
564 aa  61.6  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.26171  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16830  serine/threonine protein kinase  32.8 
 
 
559 aa  62  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.753908  normal  0.387061 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2888  Serine/threonine protein kinase-like protein  33.95 
 
 
659 aa  61.6  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.301029  normal  0.670701 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0144  serine/threonine protein kinase  32.5 
 
 
650 aa  61.6  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7434  Serine/threonine protein kinase-like protein  32.55 
 
 
673 aa  61.6  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2069  serine/threonine protein kinase  38.39 
 
 
501 aa  61.2  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.832371  normal  0.49505 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5937  serine/threonine protein kinase  34.27 
 
 
617 aa  60.8  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.346085 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  26.96 
 
 
612 aa  60.5  0.00000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3766  serine/threonine protein kinase  30.19 
 
 
571 aa  60.1  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.102258  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0729  serine/threonine protein kinase  30.22 
 
 
464 aa  59.7  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.44074  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3668  Serine/threonine protein kinase-related protein  25.26 
 
 
553 aa  59.7  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.965868  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4831  serine/threonine protein kinase  31.82 
 
 
289 aa  58.9  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2005  protein kinase  32.57 
 
 
283 aa  58.9  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.53777  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0842  serine/threonine protein kinase  29.94 
 
 
695 aa  58.9  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000042013  decreased coverage  0.00000000202513 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4540  serine/threonine protein kinase  30.2 
 
 
444 aa  58.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.261532  normal  0.395851 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4012  serine/threonine protein kinase  30.95 
 
 
528 aa  58.9  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32580  protein kinase family protein  28.96 
 
 
637 aa  58.2  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.356943  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4477  serine/threonine protein kinase  34.78 
 
 
581 aa  58.2  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.695669  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04840  protein kinase family protein  28.88 
 
 
575 aa  58.2  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.576208  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0631  serine/threonine protein kinase  30.64 
 
 
544 aa  58.2  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.108633  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0093  Serine/threonine protein kinase-like protein  25.83 
 
 
520 aa  57.4  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6520  serine/threonine protein kinase  29.38 
 
 
466 aa  57.4  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.397338  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5592  serine/threonine protein kinase  24.18 
 
 
721 aa  57.4  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.294025 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0730  serine/threonine protein kinase  26.73 
 
 
464 aa  57  0.0000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0432172  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1978  protein kinase  28.36 
 
 
482 aa  56.2  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193562  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1137  serine/threonine protein kinase  32.9 
 
 
962 aa  56.6  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0106  serine/threonine protein kinase  27.78 
 
 
674 aa  56.6  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0078  serine/threonine protein kinase  28.14 
 
 
382 aa  56.6  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7753  serine/threonine protein kinase  29.89 
 
 
489 aa  56.6  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.181718  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0229  serine/threonine protein kinase  30.4 
 
 
353 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0217  serine/threonine protein kinase  30.4 
 
 
353 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00807707  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0683  serine/threonine protein kinase  27.27 
 
 
695 aa  55.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.923157  normal  0.0435731 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0667  serine/threonine protein kinase  27.78 
 
 
636 aa  56.2  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1744  Serine/threonine protein kinase-related protein  30.81 
 
 
405 aa  56.2  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.679027  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0240  serine/threonine protein kinase  30.4 
 
 
353 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4798  serine/threonine protein kinase  31.45 
 
 
583 aa  56.2  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.609018  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00180  protein kinase family protein with PASTA domain  28.41 
 
 
951 aa  55.8  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000304613  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4264  hypothetical protein  29.65 
 
 
349 aa  55.5  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  30.07 
 
 
593 aa  55.5  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>