22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3166 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3166  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  261  2e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0829  hypothetical protein  80.8 
 
 		 125 aa  214  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000948703 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0836  hypothetical protein  80.8 
 
 		 125 aa  214  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0804  hypothetical protein  80.8 
 
 		 125 aa  214  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3532  hypothetical protein  80.8 
 
 		 125 aa  214  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0595394  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3274  hypothetical protein  76 
 
 		 125 aa  204  3e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00959502 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3452  hypothetical protein  76 
 
 		 125 aa  204  3e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685549 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0673  hypothetical protein  75.2 
 
 		 125 aa  203  8e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0399059 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0824  hypothetical protein  72.5 
 
 		 120 aa  186  8e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0538  hypothetical protein  38.02 
 
 		 120 aa  92.8  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2979  hypothetical protein  37.6 
 
 		 131 aa  86.3  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.278327  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1593  hypothetical protein  31.86 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00265658  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3907  hypothetical protein  36.97 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3815  hypothetical protein  31.36 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.70825 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0691  hypothetical protein  27.87 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.378434  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1711  hypothetical protein  29.09 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0103375  normal  0.188904 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0836  hypothetical protein  26.32 
 
 		 131 aa  52  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.408825  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2170  hypothetical protein  29.09 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0437682  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000890  hypothetical protein  29.73 
 
 		 105 aa  48.1  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06872  hypothetical protein  29.09 
 
 		 105 aa  45.4  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0567  hypothetical protein  24.56 
 
 		 114 aa  44.7  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.193169 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3139  hypothetical protein  24.35 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.78695  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>