14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06872 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06872  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  213  5e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000890  hypothetical protein  64.76 
 
 		 105 aa  142  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1711  hypothetical protein  44.23 
 
 		 104 aa  97.4  5e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0103375  normal  0.188904 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2170  hypothetical protein  44.23 
 
 		 104 aa  94  7e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0437682  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0836  hypothetical protein  42.86 
 
 		 131 aa  89.7  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.408825  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1593  hypothetical protein  30.48 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00265658  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0538  hypothetical protein  30.36 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3274  hypothetical protein  31.53 
 
 		 125 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00959502 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0673  hypothetical protein  31.53 
 
 		 125 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0399059 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3452  hypothetical protein  31.53 
 
 		 125 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685549 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0824  hypothetical protein  31.53 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0567  hypothetical protein  30.19 
 
 		 114 aa  40.8  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.193169 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3166  hypothetical protein  27.03 
 
 		 125 aa  40  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0691  hypothetical protein  27.18 
 
 		 111 aa  40  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.378434  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>