20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0538 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0538  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  249  1e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2979  hypothetical protein  44.44 
 
 		 131 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.278327  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0829  hypothetical protein  40.5 
 
 		 125 aa  90.9  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000948703 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0836  hypothetical protein  40.5 
 
 		 125 aa  90.9  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3532  hypothetical protein  40.5 
 
 		 125 aa  90.9  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0595394  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0804  hypothetical protein  40.5 
 
 		 125 aa  90.9  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0824  hypothetical protein  37.5 
 
 		 120 aa  86.7  9e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3274  hypothetical protein  36.67 
 
 		 125 aa  85.5  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00959502 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0673  hypothetical protein  36.67 
 
 		 125 aa  85.5  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0399059 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3452  hypothetical protein  36.67 
 
 		 125 aa  85.5  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685549 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3166  hypothetical protein  38.02 
 
 		 125 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3815  hypothetical protein  32.17 
 
 		 117 aa  62.4  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.70825 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1593  hypothetical protein  32.14 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00265658  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3907  hypothetical protein  31.93 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06872  hypothetical protein  30.36 
 
 		 105 aa  52.4  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0836  hypothetical protein  33.96 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.408825  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1711  hypothetical protein  28.83 
 
 		 104 aa  51.6  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0103375  normal  0.188904 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2170  hypothetical protein  26.13 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0437682  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0567  hypothetical protein  25.22 
 
 		 114 aa  44.7  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.193169 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000890  hypothetical protein  26.13 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>