20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_0836 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0829  hypothetical protein  100 
 
 
125 aa  258  2e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000948703 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0836  hypothetical protein  100 
 
 
125 aa  258  2e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0804  hypothetical protein  100 
 
 
125 aa  258  2e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3532  hypothetical protein  100 
 
 
125 aa  258  2e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0595394  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3274  hypothetical protein  76 
 
 
125 aa  207  4e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00959502 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3452  hypothetical protein  75.2 
 
 
125 aa  207  5e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00685549 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0673  hypothetical protein  75.2 
 
 
125 aa  206  1e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0399059 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3166  hypothetical protein  80.8 
 
 
125 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0824  hypothetical protein  73.33 
 
 
120 aa  190  6e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0538  hypothetical protein  40.5 
 
 
120 aa  90.9  5e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2979  hypothetical protein  38.52 
 
 
131 aa  84.3  5e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.278327  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1593  hypothetical protein  31.86 
 
 
109 aa  64.7  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00265658  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3815  hypothetical protein  34.45 
 
 
117 aa  62  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.70825 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3907  hypothetical protein  35 
 
 
121 aa  57  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1711  hypothetical protein  31.82 
 
 
104 aa  56.6  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0103375  normal  0.188904 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0691  hypothetical protein  29.84 
 
 
111 aa  52  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.378434  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2170  hypothetical protein  28.7 
 
 
104 aa  51.2  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0437682  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0836  hypothetical protein  25.22 
 
 
131 aa  46.2  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.408825  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0567  hypothetical protein  26.32 
 
 
114 aa  44.7  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.193169 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000890  hypothetical protein  28.18 
 
 
105 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>