29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0836 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009456  VC0395_0836  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  265  1e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.408825  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000890  hypothetical protein  49.52 
 
 
105 aa  104  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1711  hypothetical protein  49.02 
 
 
104 aa  100  7e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0103375  normal  0.188904 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2170  hypothetical protein  48.04 
 
 
104 aa  95.5  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0437682  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06872  hypothetical protein  42.86 
 
 
105 aa  89.7  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1593  hypothetical protein  35.51 
 
 
109 aa  60.5  0.000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00265658  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0741  putative acetyltransferase  44.32 
 
 
197 aa  53.1  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.871349  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0538  hypothetical protein  33.96 
 
 
120 aa  52  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2979  hypothetical protein  27.2 
 
 
131 aa  50.8  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.278327  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3713  hypothetical protein  42.86 
 
 
115 aa  49.7  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3274  hypothetical protein  25.22 
 
 
125 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00959502 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0673  hypothetical protein  25.22 
 
 
125 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0399059 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3452  hypothetical protein  26.09 
 
 
125 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00685549 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3166  hypothetical protein  27.19 
 
 
125 aa  48.1  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0824  hypothetical protein  25.22 
 
 
120 aa  47  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0804  hypothetical protein  25.22 
 
 
125 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0836  hypothetical protein  25.22 
 
 
125 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0829  hypothetical protein  25.22 
 
 
125 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000948703 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3532  hypothetical protein  25.22 
 
 
125 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0595394  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0919  putative acetyltransferase  80 
 
 
172 aa  45.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.240492  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0912  hypothetical protein  80.77 
 
 
61 aa  43.9  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.281616  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0922  hypothetical protein  68.97 
 
 
291 aa  42.7  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0798  putative acetyltransferase  70.37 
 
 
230 aa  43.5  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0743  hypothetical protein  73.08 
 
 
45 aa  43.5  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.472162  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0808  putative acetyltransferase  86.36 
 
 
50 aa  42.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0934  hypothetical protein  76 
 
 
217 aa  42.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.140656  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3907  hypothetical protein  26.55 
 
 
121 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0876  hypothetical protein  88.89 
 
 
33 aa  40.4  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0925  hypothetical protein  85.71 
 
 
160 aa  40.4  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>