19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1711 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1711  hypothetical protein  100 
 
 		 104 aa  211  1.9999999999999998e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0103375  normal  0.188904 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2170  hypothetical protein  77.88 
 
 		 104 aa  165  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0437682  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000890  hypothetical protein  47.12 
 
 		 105 aa  101  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0836  hypothetical protein  49.02 
 
 		 131 aa  100  7e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.408825  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06872  hypothetical protein  44.23 
 
 		 105 aa  97.4  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1593  hypothetical protein  33.64 
 
 		 109 aa  62.4  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00265658  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3532  hypothetical protein  31.82 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0595394  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0829  hypothetical protein  31.82 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000948703 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0836  hypothetical protein  31.82 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0804  hypothetical protein  31.82 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3452  hypothetical protein  30.91 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685549 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0673  hypothetical protein  30.91 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0399059 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3274  hypothetical protein  30.91 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00959502 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0824  hypothetical protein  32.69 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0538  hypothetical protein  28.83 
 
 		 120 aa  51.6  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0567  hypothetical protein  31.37 
 
 		 114 aa  48.9  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.193169 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3166  hypothetical protein  30.91 
 
 		 125 aa  43.9  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0691  hypothetical protein  30.34 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.378434  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2979  hypothetical protein  28.95 
 
 		 131 aa  41.6  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.278327  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>