18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000890 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_000890  hypothetical protein  100 
 
 
105 aa  218  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06872  hypothetical protein  64.76 
 
 
105 aa  142  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2170  hypothetical protein  48.08 
 
 
104 aa  104  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0437682  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0836  hypothetical protein  49.52 
 
 
131 aa  104  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.408825  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1711  hypothetical protein  47.12 
 
 
104 aa  101  4e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0103375  normal  0.188904 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1593  hypothetical protein  35.51 
 
 
109 aa  68.9  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00265658  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0673  hypothetical protein  28.18 
 
 
125 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0399059 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3452  hypothetical protein  28.18 
 
 
125 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00685549 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0567  hypothetical protein  33.02 
 
 
114 aa  45.4  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.193169 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3274  hypothetical protein  28.18 
 
 
125 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00959502 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0824  hypothetical protein  29.46 
 
 
120 aa  44.3  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0538  hypothetical protein  26.13 
 
 
120 aa  43.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0804  hypothetical protein  28.18 
 
 
125 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3532  hypothetical protein  28.18 
 
 
125 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0595394  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0836  hypothetical protein  28.18 
 
 
125 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0829  hypothetical protein  28.18 
 
 
125 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000948703 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2979  hypothetical protein  26.83 
 
 
131 aa  42  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.278327  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3166  hypothetical protein  29.73 
 
 
125 aa  41.2  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>