15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0567 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0567  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  237  4e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.193169 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1593  hypothetical protein  31.82 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00265658  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3815  hypothetical protein  28.44 
 
 		 117 aa  51.6  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.70825 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1711  hypothetical protein  31.37 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0103375  normal  0.188904 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3907  hypothetical protein  27.68 
 
 		 121 aa  47  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000890  hypothetical protein  33.02 
 
 		 105 aa  45.4  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3532  hypothetical protein  26.32 
 
 		 125 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0595394  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0804  hypothetical protein  26.32 
 
 		 125 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0836  hypothetical protein  26.32 
 
 		 125 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0829  hypothetical protein  26.32 
 
 		 125 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000948703 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0538  hypothetical protein  25.22 
 
 		 120 aa  44.7  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2979  hypothetical protein  22.05 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.278327  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0691  hypothetical protein  27.36 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.378434  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3166  hypothetical protein  22.81 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06872  hypothetical protein  30.19 
 
 		 105 aa  40.8  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>