22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1593 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1593  hypothetical protein  100 
 
 
109 aa  223  5.0000000000000005e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00265658  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000890  hypothetical protein  35.51 
 
 
105 aa  68.9  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0673  hypothetical protein  28.7 
 
 
125 aa  67  0.00000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0399059 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3452  hypothetical protein  29.2 
 
 
125 aa  67  0.00000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00685549 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3274  hypothetical protein  29.2 
 
 
125 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00959502 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06872  hypothetical protein  30.48 
 
 
105 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0829  hypothetical protein  31.86 
 
 
125 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000948703 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0836  hypothetical protein  31.86 
 
 
125 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0804  hypothetical protein  31.86 
 
 
125 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3532  hypothetical protein  31.86 
 
 
125 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0595394  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0824  hypothetical protein  27.83 
 
 
120 aa  63.2  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1711  hypothetical protein  33.64 
 
 
104 aa  62.4  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0103375  normal  0.188904 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3166  hypothetical protein  31.86 
 
 
125 aa  61.6  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0836  hypothetical protein  35.51 
 
 
131 aa  60.5  0.000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.408825  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2170  hypothetical protein  33.33 
 
 
104 aa  59.3  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0437682  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0538  hypothetical protein  32.14 
 
 
120 aa  56.6  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0567  hypothetical protein  31.82 
 
 
114 aa  53.1  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.193169 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2979  hypothetical protein  31.97 
 
 
131 aa  51.6  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.278327  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3815  hypothetical protein  30.84 
 
 
117 aa  48.9  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.70825 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0713  hypothetical protein  27.93 
 
 
105 aa  47.4  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.142864  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3907  hypothetical protein  28.7 
 
 
121 aa  43.9  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3139  hypothetical protein  29.63 
 
 
104 aa  43.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.78695  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>