19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2979 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2979  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  266  5.9999999999999995e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.278327  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0538  hypothetical protein  44.44 
 
 		 120 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0829  hypothetical protein  38.52 
 
 		 125 aa  84.3  5e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000948703 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0836  hypothetical protein  38.52 
 
 		 125 aa  84.3  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3532  hypothetical protein  38.52 
 
 		 125 aa  84.3  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0595394  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0804  hypothetical protein  38.52 
 
 		 125 aa  84.3  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0824  hypothetical protein  34.4 
 
 		 120 aa  82  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3274  hypothetical protein  34.4 
 
 		 125 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00959502 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3452  hypothetical protein  34.4 
 
 		 125 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685549 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0673  hypothetical protein  34.4 
 
 		 125 aa  80.1  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0399059 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3166  hypothetical protein  37.6 
 
 		 125 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1593  hypothetical protein  31.97 
 
 		 109 aa  51.6  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00265658  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0836  hypothetical protein  27.2 
 
 		 131 aa  50.8  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.408825  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3815  hypothetical protein  29.92 
 
 		 117 aa  50.1  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.70825 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3907  hypothetical protein  27.34 
 
 		 121 aa  47.8  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0567  hypothetical protein  22.05 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.193169 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0691  hypothetical protein  31.58 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.378434  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000890  hypothetical protein  26.83 
 
 		 105 aa  42  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1711  hypothetical protein  28.95 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0103375  normal  0.188904 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>