18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3907 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3907  hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  249  8.000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3815  hypothetical protein  40.71 
 
 		 117 aa  87.8  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.70825 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3139  hypothetical protein  32.43 
 
 		 104 aa  60.8  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.78695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0691  hypothetical protein  33.9 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.378434  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0829  hypothetical protein  35 
 
 		 125 aa  57  0.00000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000948703 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0836  hypothetical protein  35 
 
 		 125 aa  57  0.00000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0804  hypothetical protein  35 
 
 		 125 aa  57  0.00000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3532  hypothetical protein  35 
 
 		 125 aa  57  0.00000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0595394  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3166  hypothetical protein  34.45 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0538  hypothetical protein  31.93 
 
 		 120 aa  54.3  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3452  hypothetical protein  33.05 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685549 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0673  hypothetical protein  32.2 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0399059 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3274  hypothetical protein  32.2 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00959502 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0824  hypothetical protein  33.05 
 
 		 120 aa  51.6  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2979  hypothetical protein  27.34 
 
 		 131 aa  47.8  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.278327  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0567  hypothetical protein  27.68 
 
 		 114 aa  47  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.193169 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1593  hypothetical protein  28.7 
 
 		 109 aa  43.9  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00265658  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0836  hypothetical protein  26.55 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.408825  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>