18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3815 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3815  hypothetical protein  100 
 
 		 117 aa  241  3e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.70825 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3907  hypothetical protein  40.71 
 
 		 121 aa  87.8  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0691  hypothetical protein  35.4 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.378434  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0824  hypothetical protein  35.29 
 
 		 120 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3139  hypothetical protein  35.24 
 
 		 104 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.78695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0829  hypothetical protein  34.45 
 
 		 125 aa  62  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000948703 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0836  hypothetical protein  34.45 
 
 		 125 aa  62  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0804  hypothetical protein  34.45 
 
 		 125 aa  62  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3532  hypothetical protein  34.45 
 
 		 125 aa  62  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0595394  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0538  hypothetical protein  32.17 
 
 		 120 aa  62.4  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3452  hypothetical protein  33.61 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685549 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0673  hypothetical protein  33.61 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0399059 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3274  hypothetical protein  33.61 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00959502 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0713  hypothetical protein  33 
 
 		 105 aa  57  0.00000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.142864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3166  hypothetical protein  31.36 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0567  hypothetical protein  28.44 
 
 		 114 aa  51.6  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.193169 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2979  hypothetical protein  29.92 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.278327  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1593  hypothetical protein  30.84 
 
 		 109 aa  48.9  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00265658  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>