17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2170 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2170  hypothetical protein  100 
 
 		 104 aa  210  5.999999999999999e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0437682  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1711  hypothetical protein  77.88 
 
 		 104 aa  165  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0103375  normal  0.188904 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000890  hypothetical protein  48.08 
 
 		 105 aa  104  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0836  hypothetical protein  48.04 
 
 		 131 aa  95.5  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.408825  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06872  hypothetical protein  44.23 
 
 		 105 aa  94  7e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1593  hypothetical protein  33.33 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00265658  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3532  hypothetical protein  28.7 
 
 		 125 aa  51.2  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0595394  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0829  hypothetical protein  28.7 
 
 		 125 aa  51.2  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000948703 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0804  hypothetical protein  28.7 
 
 		 125 aa  51.2  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0836  hypothetical protein  28.7 
 
 		 125 aa  51.2  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0673  hypothetical protein  28.18 
 
 		 125 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0399059 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3452  hypothetical protein  28.18 
 
 		 125 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685549 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3274  hypothetical protein  28.18 
 
 		 125 aa  50.4  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00959502 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0824  hypothetical protein  28.18 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0538  hypothetical protein  26.13 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0691  hypothetical protein  31.46 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.378434  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3166  hypothetical protein  27.27 
 
 		 125 aa  40  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>