17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0922 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0922  hypothetical protein  100 
 
 		 291 aa  600  1e-170  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3262  hypothetical protein  33.62 
 
 		 250 aa  66.6  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5162  hypothetical protein  28.93 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.105605  normal  0.430535 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1508  hypothetical protein  31.37 
 
 		 268 aa  60.8  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.02689e-16 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0239  hypothetical protein  31.78 
 
 		 259 aa  54.3  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0225149  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6751  hypothetical protein  27.21 
 
 		 242 aa  53.9  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1830  hypothetical protein  28.19 
 
 		 241 aa  51.6  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2369  hypothetical protein  25.16 
 
 		 241 aa  50.1  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2339  hypothetical protein  24.4 
 
 		 241 aa  48.5  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000143796  unclonable  0.000000136454 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1271  hypothetical protein  24.4 
 
 		 241 aa  48.5  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1817  hypothetical protein  29.78 
 
 		 265 aa  47.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3707  hypothetical protein  32.99 
 
 		 471 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0979489 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3713  hypothetical protein  86.96 
 
 		 115 aa  45.4  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0934  hypothetical protein  82.61 
 
 		 217 aa  43.9  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.140656  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0925  hypothetical protein  85.71 
 
 		 160 aa  43.5  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0836  hypothetical protein  68.97 
 
 		 131 aa  42.7  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.408825  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0741  putative acetyltransferase  90.48 
 
 		 197 aa  42.7  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.871349  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>