15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3262 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3262  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  516  1e-146  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5162  hypothetical protein  55.41 
 
 		 254 aa  267  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.105605  normal  0.430535 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2369  hypothetical protein  40.18 
 
 		 241 aa  159  5e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6751  hypothetical protein  39.66 
 
 		 242 aa  156  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1830  hypothetical protein  39.38 
 
 		 241 aa  152  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2339  hypothetical protein  39.74 
 
 		 241 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000143796  unclonable  0.000000136454 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1271  hypothetical protein  39.74 
 
 		 241 aa  150  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1321  hypothetical protein  25.22 
 
 		 264 aa  62  0.000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3049  hypothetical protein  28.06 
 
 		 328 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0452511 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1508  hypothetical protein  25.76 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.02689e-16 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3707  hypothetical protein  30.63 
 
 		 471 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0979489 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0922  hypothetical protein  30.39 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0257  hypothetical protein  28.78 
 
 		 315 aa  55.8  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0239  hypothetical protein  31.62 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0225149  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5183  hypothetical protein  26.97 
 
 		 446 aa  43.5  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>