12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2339 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2339  hypothetical protein  100 
 
 		 241 aa  502  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000143796  unclonable  0.000000136454 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1271  hypothetical protein  100 
 
 		 241 aa  502  1e-141  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2369  hypothetical protein  90.35 
 
 		 241 aa  434  1e-121  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1830  hypothetical protein  86.31 
 
 		 241 aa  429  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6751  hypothetical protein  71.07 
 
 		 242 aa  361  6e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5162  hypothetical protein  40.77 
 
 		 254 aa  182  4.0000000000000006e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.105605  normal  0.430535 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3262  hypothetical protein  39.74 
 
 		 250 aa  150  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3049  hypothetical protein  27.12 
 
 		 328 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0452511 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1508  hypothetical protein  25.97 
 
 		 268 aa  62  0.000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.02689e-16 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1321  hypothetical protein  31.68 
 
 		 264 aa  55.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0257  hypothetical protein  26.59 
 
 		 315 aa  54.7  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3707  hypothetical protein  24.28 
 
 		 471 aa  52  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0979489 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>