14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6751 on replicon NC_010553
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010553  BamMC406_6751  hypothetical protein  100 
 
 
242 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2339  hypothetical protein  71.18 
 
 
241 aa  345  5e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000143796  unclonable  0.000000136454 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1271  hypothetical protein  71.18 
 
 
241 aa  345  5e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2369  hypothetical protein  70.31 
 
 
241 aa  343  2e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1830  hypothetical protein  68.6 
 
 
241 aa  333  1e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5162  hypothetical protein  39.13 
 
 
254 aa  169  5e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.105605  normal  0.430535 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3262  hypothetical protein  39.66 
 
 
250 aa  156  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3049  hypothetical protein  27.88 
 
 
328 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0452511 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1508  hypothetical protein  24.27 
 
 
268 aa  53.9  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  7.02689e-16 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3707  hypothetical protein  26.97 
 
 
471 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0979489 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0257  hypothetical protein  26.39 
 
 
315 aa  50.8  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1321  hypothetical protein  27.45 
 
 
264 aa  50.1  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0922  hypothetical protein  30.99 
 
 
291 aa  45.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0239  hypothetical protein  28.91 
 
 
259 aa  44.7  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0225149  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>