14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5162 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007949  Bpro_5162  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  531  1e-150  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.105605  normal  0.430535 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3262  hypothetical protein  53.88 
 
 		 250 aa  268  8e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2369  hypothetical protein  43.24 
 
 		 241 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2339  hypothetical protein  42.15 
 
 		 241 aa  180  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000143796  unclonable  0.000000136454 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1271  hypothetical protein  42.15 
 
 		 241 aa  180  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1830  hypothetical protein  39.64 
 
 		 241 aa  172  5e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6751  hypothetical protein  39.13 
 
 		 242 aa  168  6e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3049  hypothetical protein  35.11 
 
 		 328 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0452511 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0257  hypothetical protein  29.41 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0922  hypothetical protein  28.93 
 
 		 291 aa  53.9  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3707  hypothetical protein  32.93 
 
 		 471 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0979489 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1321  hypothetical protein  23.38 
 
 		 264 aa  50.4  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1508  hypothetical protein  22.69 
 
 		 268 aa  42.7  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.02689e-16 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0239  hypothetical protein  27.34 
 
 		 259 aa  42.7  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0225149  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>