124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0466 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_0466  hypothetical protein  100 
 
 
87 aa  176  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000249434  normal  0.799705 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0467  hypothetical protein  64.37 
 
 
87 aa  117  4.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000103446  normal  0.799705 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3618  hypothetical protein  64.37 
 
 
87 aa  115  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3969  hypothetical protein  64.37 
 
 
87 aa  115  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.206164  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3763  hypothetical protein  64.37 
 
 
87 aa  115  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0643388  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03098  hypothetical protein  51.72 
 
 
87 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3674  hypothetical protein  55.68 
 
 
88 aa  95.1  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.45062 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3553  protein YhcN  51.72 
 
 
87 aa  95.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.554775  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3552  protein YhcN  51.72 
 
 
87 aa  95.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3624  hypothetical protein  51.72 
 
 
87 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.392206 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3721  hypothetical protein  51.72 
 
 
87 aa  94.4  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.344064 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4555  protein YcfR  50.57 
 
 
104 aa  94  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.421105  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0468  protein of unknown function DUF1471  50.57 
 
 
87 aa  94  7e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3427  protein YcfR  50.57 
 
 
87 aa  94  7e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.928315  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3721  protein YcfR  50.57 
 
 
87 aa  94  7e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0468  hypothetical protein  50.57 
 
 
87 aa  94  7e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.291673 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3534  protein YcfR  50.57 
 
 
87 aa  94  7e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.780594  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3538  protein YcfR  50.57 
 
 
87 aa  94  7e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3659  hypothetical protein  50.57 
 
 
87 aa  92.8  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187702  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3673  hypothetical protein  50.57 
 
 
87 aa  92.4  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.444536 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3625  hypothetical protein  50 
 
 
88 aa  87  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.266928 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3660  hypothetical protein  50 
 
 
88 aa  87  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.332792  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3554  hypothetical protein  50 
 
 
88 aa  87  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.563854  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3553  hypothetical protein  50 
 
 
88 aa  87  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3722  hypothetical protein  50 
 
 
88 aa  87  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.414513 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3987  hypothetical protein  40.23 
 
 
89 aa  62  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3747  hypothetical protein  40.23 
 
 
89 aa  62  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0166  hypothetical protein  40.23 
 
 
89 aa  62  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.650256  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2039  protein of unknown function DUF1471  34.44 
 
 
314 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00133336  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4432  hypothetical protein  37.63 
 
 
95 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4748  hypothetical protein  37.63 
 
 
95 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.644258  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4659  hypothetical protein  37.63 
 
 
95 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.642992 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5704  hypothetical protein  37.63 
 
 
95 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01573  hypothetical protein  34.44 
 
 
314 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01563  hypothetical protein  34.44 
 
 
314 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.885779  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1679  YdgH protein  34.44 
 
 
314 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.434998  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1812  YdgH protein  34.44 
 
 
314 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00909814  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2026  hypothetical protein  34.44 
 
 
314 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1595  YdgH protein  34.44 
 
 
314 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0332868  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1790  YdgH protein  34.44 
 
 
314 aa  58.5  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0421075  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0088  hypothetical protein  39.56 
 
 
96 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2314  YdgH protein  34.44 
 
 
314 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.842613  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0092  probable secreted protein  39.56 
 
 
96 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04055  hypothetical protein  38.46 
 
 
91 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3805  protein of unknown function DUF1471  38.46 
 
 
91 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04017  hypothetical protein  38.46 
 
 
91 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3825  hypothetical protein  38.46 
 
 
91 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000178738 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4718  hypothetical protein  36.56 
 
 
95 aa  57  0.00000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0093  probable secreted protein  39.56 
 
 
96 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.494057 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1488  hypothetical protein  40.74 
 
 
86 aa  56.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4631  hypothetical protein  37.78 
 
 
93 aa  55.5  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1779  hypothetical protein  40.74 
 
 
86 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.23903 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1595  hypothetical protein  40.74 
 
 
86 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0088  hypothetical protein  38.46 
 
 
96 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.596949  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2109  hypothetical protein  38.46 
 
 
317 aa  54.3  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.129908  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0445  hypothetical protein  37.5 
 
 
88 aa  53.9  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00418415 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4739  hypothetical protein  37.14 
 
 
91 aa  53.9  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.236332  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4796  hypothetical protein  37.14 
 
 
91 aa  53.9  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.329964  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4646  protein YjfN  37.14 
 
 
91 aa  53.9  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4656  protein YjfN  37.14 
 
 
91 aa  53.9  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4775  hypothetical protein  37.14 
 
 
91 aa  53.9  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0442  hypothetical protein  33.33 
 
 
91 aa  53.5  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.836978  hitchhiker  0.000475727 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04066  hypothetical protein  44.44 
 
 
91 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3794  protein of unknown function DUF1471  44.44 
 
 
91 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.040427  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4443  hypothetical protein  44.44 
 
 
91 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4760  hypothetical protein  44.44 
 
 
91 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3814  hypothetical protein  44.44 
 
 
91 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0544212 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4670  hypothetical protein  44.44 
 
 
91 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.915297  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4732  hypothetical protein  44.44 
 
 
91 aa  51.2  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.264602  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5715  hypothetical protein  44.44 
 
 
91 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.558368  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04028  hypothetical protein  44.44 
 
 
91 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0367  hypothetical protein  32 
 
 
95 aa  50.4  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0286691 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1587  hypothetical protein  38.89 
 
 
314 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.48706  normal  0.33629 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1646  hypothetical protein  38.89 
 
 
314 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.79499  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1578  protein YdgH  38.89 
 
 
314 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.505829  normal  0.109067 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4658  protein YjfY  42.53 
 
 
91 aa  50.4  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1696  protein YdgH  38.89 
 
 
314 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00255729  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1863  hypothetical protein  38.89 
 
 
314 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.335032  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1829  hypothetical protein  35.56 
 
 
317 aa  48.9  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.74351  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2297  hypothetical protein  35.56 
 
 
317 aa  48.9  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1940  hypothetical protein  35.56 
 
 
317 aa  48.9  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4668  protein YjfY  41.38 
 
 
91 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.192543  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00773  hypothetical protein  36.78 
 
 
86 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2836  protein of unknown function DUF1471  36.78 
 
 
86 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.680807  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2837  hypothetical protein  36.78 
 
 
86 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.289732  normal  0.42216 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00790  hypothetical protein  36.78 
 
 
86 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0955  hypothetical protein  36.78 
 
 
86 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0818047  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0861  hypothetical protein  36.78 
 
 
134 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.255089  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2544  hypothetical protein  36.78 
 
 
134 aa  47.8  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2402  protein of unknown function DUF1471  35.16 
 
 
317 aa  47.8  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.326621  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0875  hypothetical protein  36.78 
 
 
134 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0913603  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0830  hypothetical protein  36.78 
 
 
86 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.324676  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3824  hypothetical protein  36.67 
 
 
89 aa  47.4  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01108  hypothetical protein  39.02 
 
 
85 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2535  protein of unknown function DUF1471  39.02 
 
 
85 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0283942  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0370  hypothetical protein  36.26 
 
 
91 aa  46.6  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.114454  normal  0.0265365 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1235  hypothetical protein  39.02 
 
 
85 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1234  hypothetical protein  39.02 
 
 
85 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.124074  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1492  hypothetical protein  39.02 
 
 
85 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0142417 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2489  hypothetical protein  39.02 
 
 
85 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17858  hitchhiker  0.000290126 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>