29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_2026 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_2039  protein of unknown function DUF1471  99.68 
 
 		 314 aa  634    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00133336  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01563  hypothetical protein  100 
 
 		 314 aa  636    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.885779  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2314  YdgH protein  100 
 
 		 314 aa  636    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.842613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1790  YdgH protein  100 
 
 		 314 aa  636    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0421075  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1595  YdgH protein  100 
 
 		 314 aa  636    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0332868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2026  hypothetical protein  100 
 
 		 314 aa  636    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1812  YdgH protein  100 
 
 		 314 aa  636    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00909814  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01573  hypothetical protein  100 
 
 		 314 aa  636    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1679  YdgH protein  100 
 
 		 314 aa  636    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.434998  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1863  hypothetical protein  90.13 
 
 		 314 aa  549  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.335032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1587  hypothetical protein  90.13 
 
 		 314 aa  549  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.48706  normal  0.33629 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1646  hypothetical protein  90.13 
 
 		 314 aa  549  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.79499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1696  protein YdgH  90.13 
 
 		 314 aa  549  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00255729  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1578  protein YdgH  89.17 
 
 		 314 aa  545  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.505829  normal  0.109067 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1848  hypothetical protein  81.85 
 
 		 314 aa  494  9.999999999999999e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.156695  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2586  hypothetical protein  71.2 
 
 		 316 aa  429  1e-119  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2297  hypothetical protein  70.35 
 
 		 317 aa  419  1e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1829  hypothetical protein  70.35 
 
 		 317 aa  419  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.74351  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1940  hypothetical protein  70.03 
 
 		 317 aa  417  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2402  protein of unknown function DUF1471  66.88 
 
 		 317 aa  398  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.326621  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2109  hypothetical protein  68.14 
 
 		 317 aa  400  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.129908  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2077  protein of unknown function DUF1471  62.46 
 
 		 316 aa  344  1e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1860  protein of unknown function DUF1471  56.33 
 
 		 312 aa  293  3e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0466  hypothetical protein  34.44 
 
 		 87 aa  58.5  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000249434  normal  0.799705 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3618  hypothetical protein  31.11 
 
 		 87 aa  50.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3763  hypothetical protein  31.11 
 
 		 87 aa  50.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0643388  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3969  hypothetical protein  31.11 
 
 		 87 aa  50.1  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.206164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0467  hypothetical protein  31.11 
 
 		 87 aa  46.2  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000103446  normal  0.799705 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3552  protein YhcN  27.78 
 
 		 87 aa  42.7  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>