33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2109 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2109  hypothetical protein  100 
 
 		 317 aa  646    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.129908  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2402  protein of unknown function DUF1471  87.38 
 
 		 317 aa  536  1e-151  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.326621  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2586  hypothetical protein  69.81 
 
 		 316 aa  416  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1829  hypothetical protein  68.97 
 
 		 317 aa  402  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.74351  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2297  hypothetical protein  68.97 
 
 		 317 aa  402  1e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1940  hypothetical protein  68.65 
 
 		 317 aa  400  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1848  hypothetical protein  68.14 
 
 		 314 aa  387  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.156695  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1863  hypothetical protein  66.25 
 
 		 314 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.335032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1696  protein YdgH  66.25 
 
 		 314 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00255729  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1578  protein YdgH  65.62 
 
 		 314 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.505829  normal  0.109067 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1646  hypothetical protein  66.25 
 
 		 314 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.79499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1587  hypothetical protein  66.25 
 
 		 314 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.48706  normal  0.33629 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1790  YdgH protein  68.14 
 
 		 314 aa  382  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0421075  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2077  protein of unknown function DUF1471  67.92 
 
 		 316 aa  382  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01563  hypothetical protein  68.14 
 
 		 314 aa  382  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.885779  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2314  YdgH protein  68.14 
 
 		 314 aa  382  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.842613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1595  YdgH protein  68.14 
 
 		 314 aa  382  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0332868  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01573  hypothetical protein  68.14 
 
 		 314 aa  382  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2026  hypothetical protein  68.14 
 
 		 314 aa  382  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1679  YdgH protein  68.14 
 
 		 314 aa  382  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.434998  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1812  YdgH protein  68.14 
 
 		 314 aa  382  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00909814  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2039  protein of unknown function DUF1471  67.82 
 
 		 314 aa  381  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00133336  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1860  protein of unknown function DUF1471  59.31 
 
 		 312 aa  315  9e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0466  hypothetical protein  38.46 
 
 		 87 aa  54.3  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000249434  normal  0.799705 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3552  protein YhcN  32.97 
 
 		 87 aa  49.7  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3969  hypothetical protein  35.16 
 
 		 87 aa  48.9  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.206164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3721  hypothetical protein  32.97 
 
 		 87 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.344064 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3763  hypothetical protein  35.16 
 
 		 87 aa  48.9  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0643388  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3618  hypothetical protein  35.16 
 
 		 87 aa  48.9  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3624  hypothetical protein  32.97 
 
 		 87 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.392206 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3659  hypothetical protein  31.87 
 
 		 87 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3553  protein YhcN  31.87 
 
 		 87 aa  47  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.554775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0467  hypothetical protein  35.16 
 
 		 87 aa  45.4  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000103446  normal  0.799705 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>