119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A3721 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A3721  hypothetical protein  100 
 
 		 87 aa  176  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.344064 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3624  hypothetical protein  98.85 
 
 		 87 aa  175  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.392206 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3552  protein YhcN  97.7 
 
 		 87 aa  174  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3553  protein YhcN  97.7 
 
 		 87 aa  173  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.554775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3659  hypothetical protein  96.55 
 
 		 87 aa  172  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187702  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0468  protein of unknown function DUF1471  79.31 
 
 		 87 aa  142  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3427  protein YcfR  79.31 
 
 		 87 aa  142  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.928315  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3721  protein YcfR  79.31 
 
 		 87 aa  142  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0468  hypothetical protein  79.31 
 
 		 87 aa  142  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.291673 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3534  protein YcfR  79.31 
 
 		 87 aa  142  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.780594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3538  protein YcfR  79.31 
 
 		 87 aa  142  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4555  protein YcfR  79.31 
 
 		 104 aa  142  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.421105  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03098  hypothetical protein  78.16 
 
 		 87 aa  138  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3673  hypothetical protein  71.26 
 
 		 87 aa  134  5e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.444536 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0467  hypothetical protein  56.32 
 
 		 87 aa  106  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000103446  normal  0.799705 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3618  hypothetical protein  52.87 
 
 		 87 aa  97.8  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3969  hypothetical protein  52.87 
 
 		 87 aa  97.8  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.206164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3763  hypothetical protein  52.87 
 
 		 87 aa  97.8  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0643388  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3625  hypothetical protein  53.41 
 
 		 88 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.266928 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3660  hypothetical protein  53.41 
 
 		 88 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.332792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3554  hypothetical protein  53.41 
 
 		 88 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.563854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3553  hypothetical protein  53.41 
 
 		 88 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3722  hypothetical protein  53.41 
 
 		 88 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.414513 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3674  hypothetical protein  53.41 
 
 		 88 aa  95.1  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.45062 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0466  hypothetical protein  51.72 
 
 		 87 aa  94.4  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000249434  normal  0.799705 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3987  hypothetical protein  42.7 
 
 		 89 aa  65.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3747  hypothetical protein  42.7 
 
 		 89 aa  65.9  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0166  hypothetical protein  42.7 
 
 		 89 aa  65.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.650256  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3924  protein of unknown function DUF1471  41.38 
 
 		 85 aa  61.6  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0022  hypothetical protein  46.05 
 
 		 85 aa  60.8  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0028  protein of unknown function DUF1471  44.74 
 
 		 85 aa  60.5  0.000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.20234  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00769  hypothetical protein  47.73 
 
 		 86 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2840  protein of unknown function DUF1471  47.73 
 
 		 86 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0857  hypothetical protein  47.73 
 
 		 86 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0870  hypothetical protein  47.73 
 
 		 86 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2841  hypothetical protein  47.73 
 
 		 86 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.907908  normal  0.0578067 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00786  hypothetical protein  47.73 
 
 		 86 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0951  hypothetical protein  47.73 
 
 		 86 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4110  protein of unknown function DUF1471  47.22 
 
 		 85 aa  57.4  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0826  hypothetical protein  46.59 
 
 		 86 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1291  hypothetical protein  43.02 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0900385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2550  hypothetical protein  50 
 
 		 76 aa  55.1  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3824  hypothetical protein  38.89 
 
 		 89 aa  54.7  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4631  hypothetical protein  42.7 
 
 		 93 aa  53.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0445  hypothetical protein  38.82 
 
 		 88 aa  52  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00418415 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1488  hypothetical protein  36.47 
 
 		 86 aa  50.4  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3536  protein of unknown function DUF1471  40.91 
 
 		 83 aa  50.4  0.000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.177081  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1779  hypothetical protein  36.47 
 
 		 86 aa  50.4  0.000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.23903 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1595  hypothetical protein  36.47 
 
 		 86 aa  50.4  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0887  hypothetical protein  50 
 
 		 86 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0951  hypothetical protein  50 
 
 		 86 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0972  hypothetical protein  50 
 
 		 86 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0860  hypothetical protein  50 
 
 		 86 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0919  hypothetical protein  50 
 
 		 86 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0088  hypothetical protein  37.08 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0088  hypothetical protein  37.08 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.596949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0092  probable secreted protein  37.08 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2109  hypothetical protein  32.97 
 
 		 317 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.129908  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0093  probable secreted protein  37.08 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.494057 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0367  hypothetical protein  38.67 
 
 		 95 aa  48.5  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0286691 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04055  hypothetical protein  41.43 
 
 		 91 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3805  protein of unknown function DUF1471  41.43 
 
 		 91 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04017  hypothetical protein  41.43 
 
 		 91 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4432  hypothetical protein  41.43 
 
 		 95 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4748  hypothetical protein  41.43 
 
 		 95 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.644258  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5704  hypothetical protein  41.43 
 
 		 95 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3825  hypothetical protein  41.43 
 
 		 91 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000178738 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4659  hypothetical protein  41.43 
 
 		 95 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.642992 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4739  hypothetical protein  40 
 
 		 91 aa  47.4  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.236332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4796  hypothetical protein  40 
 
 		 91 aa  47.4  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.329964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4646  protein YjfN  40 
 
 		 91 aa  47.4  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4656  protein YjfN  40 
 
 		 91 aa  47.4  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4775  hypothetical protein  40 
 
 		 91 aa  47.4  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2402  protein of unknown function DUF1471  30.77 
 
 		 317 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.326621  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00773  hypothetical protein  39.33 
 
 		 86 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01108  hypothetical protein  32.94 
 
 		 85 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2535  protein of unknown function DUF1471  32.94 
 
 		 85 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0283942  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2836  protein of unknown function DUF1471  39.33 
 
 		 86 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.680807  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0861  hypothetical protein  39.33 
 
 		 134 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.255089  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1235  hypothetical protein  32.94 
 
 		 85 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1234  hypothetical protein  32.94 
 
 		 85 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.124074  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2489  hypothetical protein  32.94 
 
 		 85 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17858  hitchhiker  0.000290126 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2837  hypothetical protein  39.33 
 
 		 86 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.289732  normal  0.42216 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2014  hypothetical protein  32.94 
 
 		 85 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221755 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01116  hypothetical protein  32.94 
 
 		 85 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2544  hypothetical protein  39.33 
 
 		 134 aa  45.4  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0955  hypothetical protein  39.33 
 
 		 86 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0818047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1492  hypothetical protein  32.94 
 
 		 85 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0142417 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00790  hypothetical protein  39.33 
 
 		 86 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0830  hypothetical protein  39.33 
 
 		 86 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.324676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4718  hypothetical protein  40 
 
 		 95 aa  45.4  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2131  protein of unknown function DUF1471  38.37 
 
 		 75 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1290  protein YcfR  35.29 
 
 		 85 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1829  hypothetical protein  30 
 
 		 317 aa  44.3  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.74351  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0875  hypothetical protein  37.5 
 
 		 134 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0913603  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2297  hypothetical protein  30 
 
 		 317 aa  44.3  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1940  hypothetical protein  30 
 
 		 317 aa  44.3  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1056  hypothetical protein  37.08 
 
 		 91 aa  44.3  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0107065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0370  hypothetical protein  31.87 
 
 		 91 aa  43.9  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.114454  normal  0.0265365 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1627  hypothetical protein  32.94 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.884329  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>