40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E4718 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E4718  hypothetical protein  100 
 
 		 95 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5704  hypothetical protein  98.95 
 
 		 95 aa  193  7e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4659  hypothetical protein  98.95 
 
 		 95 aa  193  7e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.642992 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4748  hypothetical protein  98.95 
 
 		 95 aa  193  7e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.644258  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4432  hypothetical protein  98.95 
 
 		 95 aa  193  7e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04055  hypothetical protein  98.9 
 
 		 91 aa  185  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04017  hypothetical protein  98.9 
 
 		 91 aa  185  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3825  hypothetical protein  98.9 
 
 		 91 aa  185  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000178738 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3805  protein of unknown function DUF1471  98.9 
 
 		 91 aa  185  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4656  protein YjfN  79.12 
 
 		 91 aa  136  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4796  hypothetical protein  79.12 
 
 		 91 aa  136  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.329964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4739  hypothetical protein  79.12 
 
 		 91 aa  136  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.236332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0367  hypothetical protein  74.74 
 
 		 95 aa  136  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0286691 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4775  hypothetical protein  79.12 
 
 		 91 aa  136  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4646  protein YjfN  79.12 
 
 		 91 aa  136  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0442  hypothetical protein  57.53 
 
 		 91 aa  88.2  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.836978  hitchhiker  0.000475727 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0466  hypothetical protein  36.56 
 
 		 87 aa  57  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000249434  normal  0.799705 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3674  hypothetical protein  33.33 
 
 		 88 aa  50.8  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.45062 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3722  hypothetical protein  34.41 
 
 		 88 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.414513 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3553  hypothetical protein  34.41 
 
 		 88 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3625  hypothetical protein  34.41 
 
 		 88 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.266928 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3554  hypothetical protein  34.41 
 
 		 88 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.563854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3660  hypothetical protein  34.41 
 
 		 88 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.332792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3721  hypothetical protein  40 
 
 		 87 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.344064 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3673  hypothetical protein  37.14 
 
 		 87 aa  44.7  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.444536 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3624  hypothetical protein  38.57 
 
 		 87 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.392206 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3552  protein YhcN  38.57 
 
 		 87 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3553  protein YhcN  38.57 
 
 		 87 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.554775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3659  hypothetical protein  38.57 
 
 		 87 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187702  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03098  hypothetical protein  37.5 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0771  putative biofilm stress and motility protein A  32.47 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0137672  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0467  hypothetical protein  30.11 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000103446  normal  0.799705 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3538  protein YcfR  37.74 
 
 		 87 aa  41.2  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3534  protein YcfR  37.74 
 
 		 87 aa  41.2  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.780594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0468  hypothetical protein  37.74 
 
 		 87 aa  41.2  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.291673 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0468  protein of unknown function DUF1471  37.74 
 
 		 87 aa  41.2  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3721  protein YcfR  37.74 
 
 		 87 aa  41.2  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3427  protein YcfR  37.74 
 
 		 87 aa  41.2  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.928315  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0443  putative biofilm stress and motility protein A  38.16 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000468468 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4555  protein YcfR  37.74 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.421105  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>