67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A3625 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011149  SeAg_B3553  hypothetical protein  100 
 
 		 88 aa  181  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3722  hypothetical protein  100 
 
 		 88 aa  181  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.414513 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3625  hypothetical protein  100 
 
 		 88 aa  181  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.266928 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3660  hypothetical protein  100 
 
 		 88 aa  181  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.332792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3554  hypothetical protein  100 
 
 		 88 aa  181  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.563854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3674  hypothetical protein  69.32 
 
 		 88 aa  135  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.45062 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3673  hypothetical protein  55.68 
 
 		 87 aa  103  8e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.444536 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03098  hypothetical protein  54.55 
 
 		 87 aa  100  6e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0468  protein of unknown function DUF1471  53.41 
 
 		 87 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3427  protein YcfR  53.41 
 
 		 87 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.928315  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3721  protein YcfR  53.41 
 
 		 87 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3538  protein YcfR  53.41 
 
 		 87 aa  98.2  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3534  protein YcfR  53.41 
 
 		 87 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.780594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0468  hypothetical protein  53.41 
 
 		 87 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.291673 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4555  protein YcfR  53.41 
 
 		 104 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.421105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3552  protein YhcN  53.41 
 
 		 87 aa  96.3  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3659  hypothetical protein  53.41 
 
 		 87 aa  96.3  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3624  hypothetical protein  53.41 
 
 		 87 aa  96.3  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.392206 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3721  hypothetical protein  53.41 
 
 		 87 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.344064 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3553  protein YhcN  52.27 
 
 		 87 aa  94  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.554775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0466  hypothetical protein  50 
 
 		 87 aa  87  8e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000249434  normal  0.799705 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0467  hypothetical protein  48.86 
 
 		 87 aa  86.7  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000103446  normal  0.799705 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3618  hypothetical protein  45.45 
 
 		 87 aa  85.9  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3969  hypothetical protein  45.45 
 
 		 87 aa  85.9  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.206164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3763  hypothetical protein  45.45 
 
 		 87 aa  85.9  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0643388  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0093  probable secreted protein  41.11 
 
 		 96 aa  52.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.494057 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0088  hypothetical protein  40 
 
 		 96 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.596949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0092  probable secreted protein  40 
 
 		 96 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0088  hypothetical protein  40 
 
 		 96 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1829  hypothetical protein  32.22 
 
 		 317 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.74351  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1940  hypothetical protein  32.22 
 
 		 317 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2297  hypothetical protein  32.22 
 
 		 317 aa  49.7  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2131  protein of unknown function DUF1471  41.11 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0028  protein of unknown function DUF1471  38.37 
 
 		 85 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.20234  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4659  hypothetical protein  34.41 
 
 		 95 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.642992 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4748  hypothetical protein  34.41 
 
 		 95 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.644258  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4432  hypothetical protein  34.41 
 
 		 95 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5704  hypothetical protein  34.41 
 
 		 95 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3805  protein of unknown function DUF1471  35.56 
 
 		 91 aa  47  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04055  hypothetical protein  35.56 
 
 		 91 aa  47  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3825  hypothetical protein  35.56 
 
 		 91 aa  47  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000178738 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04017  hypothetical protein  35.56 
 
 		 91 aa  47  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4739  hypothetical protein  42.86 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.236332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4796  hypothetical protein  42.86 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.329964  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0022  hypothetical protein  36.05 
 
 		 85 aa  47  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4646  protein YjfN  42.86 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4656  protein YjfN  42.86 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4775  hypothetical protein  42.86 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4718  hypothetical protein  34.41 
 
 		 95 aa  46.2  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3924  protein of unknown function DUF1471  35.23 
 
 		 85 aa  46.2  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0166  hypothetical protein  35.14 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.650256  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3747  hypothetical protein  35.14 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0367  hypothetical protein  36.51 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0286691 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3987  hypothetical protein  35.14 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1595  hypothetical protein  33.72 
 
 		 86 aa  44.7  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1779  hypothetical protein  33.72 
 
 		 86 aa  44.7  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.23903 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1488  hypothetical protein  33.72 
 
 		 86 aa  44.7  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4631  hypothetical protein  31.82 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1844  hypothetical protein  38.89 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0707  protein of unknown function DUF1471  43.18 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1012  hypothetical protein  42.86 
 
 		 94 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.507049 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4435  hypothetical protein  35.23 
 
 		 86 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.977465 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01155  hypothetical protein  36.84 
 
 		 481 aa  41.6  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3536  protein of unknown function DUF1471  34.09 
 
 		 83 aa  41.2  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.177081  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2402  protein of unknown function DUF1471  31.4 
 
 		 317 aa  41.2  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.326621  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4110  protein of unknown function DUF1471  35.62 
 
 		 85 aa  40.4  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2109  hypothetical protein  30.23 
 
 		 317 aa  40.4  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.129908  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>