89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1012 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1012  hypothetical protein  100 
 
 		 94 aa  186  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.507049 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0467  hypothetical protein  41.05 
 
 		 87 aa  63.9  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000103446  normal  0.799705 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0466  hypothetical protein  37.5 
 
 		 87 aa  60.5  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000249434  normal  0.799705 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3722  hypothetical protein  42.17 
 
 		 88 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.414513 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3553  hypothetical protein  42.17 
 
 		 88 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3554  hypothetical protein  42.17 
 
 		 88 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.563854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3660  hypothetical protein  42.17 
 
 		 88 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.332792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3625  hypothetical protein  42.17 
 
 		 88 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.266928 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3763  hypothetical protein  36.9 
 
 		 87 aa  57  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0643388  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3618  hypothetical protein  36.9 
 
 		 87 aa  57  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3969  hypothetical protein  36.9 
 
 		 87 aa  57  0.00000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.206164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3673  hypothetical protein  36.84 
 
 		 87 aa  54.7  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.444536 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03098  hypothetical protein  36.84 
 
 		 87 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3674  hypothetical protein  40.96 
 
 		 88 aa  53.5  0.0000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.45062 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3721  protein YcfR  35.79 
 
 		 87 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3538  protein YcfR  35.79 
 
 		 87 aa  51.2  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0468  hypothetical protein  35.79 
 
 		 87 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.291673 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3534  protein YcfR  35.79 
 
 		 87 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.780594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4555  protein YcfR  35.79 
 
 		 104 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.421105  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0468  protein of unknown function DUF1471  35.79 
 
 		 87 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3427  protein YcfR  35.79 
 
 		 87 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.928315  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4658  protein YjfY  29.9 
 
 		 91 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4646  protein YjfN  41.38 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4739  hypothetical protein  41.38 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.236332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4796  hypothetical protein  41.38 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.329964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4656  protein YjfN  41.38 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4775  hypothetical protein  41.38 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5704  hypothetical protein  34.48 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4718  hypothetical protein  34.48 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4659  hypothetical protein  34.48 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.642992 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4432  hypothetical protein  34.48 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4748  hypothetical protein  34.48 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.644258  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04017  hypothetical protein  34.48 
 
 		 91 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3805  protein of unknown function DUF1471  34.48 
 
 		 91 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04055  hypothetical protein  34.48 
 
 		 91 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3825  hypothetical protein  34.48 
 
 		 91 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000178738 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3814  hypothetical protein  33.33 
 
 		 91 aa  47  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0544212 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3552  protein YhcN  35.42 
 
 		 87 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4760  hypothetical protein  33.33 
 
 		 91 aa  47  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4670  hypothetical protein  33.33 
 
 		 91 aa  47  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.915297  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3794  protein of unknown function DUF1471  33.33 
 
 		 91 aa  47  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.040427  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5715  hypothetical protein  33.33 
 
 		 91 aa  47  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.558368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4443  hypothetical protein  33.33 
 
 		 91 aa  47  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4732  hypothetical protein  33.33 
 
 		 91 aa  47  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.264602  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04028  hypothetical protein  33.33 
 
 		 91 aa  47  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4740  putative biofilm stress and motility protein A  35.48 
 
 		 100 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.613855  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04066  hypothetical protein  33.33 
 
 		 91 aa  47  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4668  protein YjfY  28.87 
 
 		 91 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.192543  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3624  hypothetical protein  35.42 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.392206 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2039  protein of unknown function DUF1471  29.76 
 
 		 314 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00133336  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3659  hypothetical protein  35.42 
 
 		 87 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3721  hypothetical protein  35.42 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.344064 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0367  hypothetical protein  36.21 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0286691 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01563  hypothetical protein  29.76 
 
 		 314 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.885779  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1812  YdgH protein  29.76 
 
 		 314 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00909814  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2314  YdgH protein  29.76 
 
 		 314 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.842613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1679  YdgH protein  29.76 
 
 		 314 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.434998  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4657  putative biofilm stress and motility protein A  35.48 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0368  putative biofilm stress and motility protein A  38.81 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.883495  normal  0.028319 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4647  putative biofilm stress and motility protein A  35.48 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2026  hypothetical protein  29.76 
 
 		 314 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4797  putative biofilm stress and motility protein A  35.48 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1595  YdgH protein  29.76 
 
 		 314 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0332868  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01573  hypothetical protein  29.76 
 
 		 314 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1790  YdgH protein  29.76 
 
 		 314 aa  45.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0421075  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0445  hypothetical protein  33.33 
 
 		 88 aa  45.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00418415 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3553  protein YhcN  36.47 
 
 		 87 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.554775  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0771  putative biofilm stress and motility protein A  36.49 
 
 		 122 aa  43.9  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0137672  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4128  protein of unknown function DUF1471  38.2 
 
 		 88 aa  43.9  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4121  protein of unknown function DUF1471  38.54 
 
 		 88 aa  42.7  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0022  hypothetical protein  40.91 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4435  hypothetical protein  41.86 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.977465 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0370  hypothetical protein  29.79 
 
 		 91 aa  42.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.114454  normal  0.0265365 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5705  putative biofilm stress and motility protein A  32.84 
 
 		 109 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4749  putative biofilm stress and motility protein A  32.84 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4719  putative biofilm stress and motility protein A  32.84 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4433  putative biofilm stress and motility protein A  32.84 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4660  putative biofilm stress and motility protein A  32.84 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.749494 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1646  hypothetical protein  28.79 
 
 		 314 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.79499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1863  hypothetical protein  28.79 
 
 		 314 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.335032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1696  protein YdgH  28.79 
 
 		 314 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00255729  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1578  protein YdgH  28.79 
 
 		 314 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.505829  normal  0.109067 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1587  hypothetical protein  28.79 
 
 		 314 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.48706  normal  0.33629 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4776  putative biofilm stress and motility protein A  35.48 
 
 		 100 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4750  hypothetical protein  28.42 
 
 		 91 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0166  hypothetical protein  29.9 
 
 		 89 aa  40.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.650256  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3987  hypothetical protein  29.9 
 
 		 89 aa  40.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3747  hypothetical protein  29.9 
 
 		 89 aa  40.4  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0028  protein of unknown function DUF1471  38.64 
 
 		 85 aa  40.4  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.20234  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>