116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E3538 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_4555  protein YcfR  100 
 
 		 104 aa  176  8e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.421105  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0468  protein of unknown function DUF1471  100 
 
 		 87 aa  176  9e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3427  protein YcfR  100 
 
 		 87 aa  176  9e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.928315  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3721  protein YcfR  100 
 
 		 87 aa  176  9e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0468  hypothetical protein  100 
 
 		 87 aa  176  9e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.291673 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3534  protein YcfR  100 
 
 		 87 aa  176  9e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.780594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3538  protein YcfR  100 
 
 		 87 aa  176  9e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03098  hypothetical protein  98.85 
 
 		 87 aa  173  7e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3624  hypothetical protein  80.46 
 
 		 87 aa  144  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.392206 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3552  protein YhcN  79.31 
 
 		 87 aa  143  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3673  hypothetical protein  75.86 
 
 		 87 aa  142  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.444536 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3553  protein YhcN  79.31 
 
 		 87 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.554775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3721  hypothetical protein  79.31 
 
 		 87 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.344064 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3659  hypothetical protein  78.16 
 
 		 87 aa  141  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0467  hypothetical protein  60.92 
 
 		 87 aa  113  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000103446  normal  0.799705 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3618  hypothetical protein  54.02 
 
 		 87 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3969  hypothetical protein  54.02 
 
 		 87 aa  102  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.206164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3763  hypothetical protein  54.02 
 
 		 87 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0643388  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3625  hypothetical protein  53.41 
 
 		 88 aa  98.2  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.266928 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3660  hypothetical protein  53.41 
 
 		 88 aa  98.2  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.332792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3554  hypothetical protein  53.41 
 
 		 88 aa  98.2  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.563854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3553  hypothetical protein  53.41 
 
 		 88 aa  98.2  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3722  hypothetical protein  53.41 
 
 		 88 aa  98.2  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.414513 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0466  hypothetical protein  50.57 
 
 		 87 aa  94  7e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000249434  normal  0.799705 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3674  hypothetical protein  51.14 
 
 		 88 aa  92.8  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.45062 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3987  hypothetical protein  46.07 
 
 		 89 aa  68.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3747  hypothetical protein  46.07 
 
 		 89 aa  68.9  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0166  hypothetical protein  46.07 
 
 		 89 aa  68.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.650256  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3924  protein of unknown function DUF1471  42.53 
 
 		 85 aa  62.8  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0028  protein of unknown function DUF1471  43.68 
 
 		 85 aa  61.6  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.20234  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1291  hypothetical protein  44.71 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0900385  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0022  hypothetical protein  42.53 
 
 		 85 aa  58.2  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4110  protein of unknown function DUF1471  47.22 
 
 		 85 aa  57.4  0.00000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1488  hypothetical protein  37.21 
 
 		 86 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1779  hypothetical protein  37.21 
 
 		 86 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.23903 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1595  hypothetical protein  37.21 
 
 		 86 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00769  hypothetical protein  44.83 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2840  protein of unknown function DUF1471  44.83 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3824  hypothetical protein  38.89 
 
 		 89 aa  55.5  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00786  hypothetical protein  44.83 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0857  hypothetical protein  44.83 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0870  hypothetical protein  44.83 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2841  hypothetical protein  44.83 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.907908  normal  0.0578067 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3536  protein of unknown function DUF1471  43.68 
 
 		 83 aa  56.2  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.177081  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0951  hypothetical protein  44.83 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1290  protein YcfR  38.82 
 
 		 85 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0826  hypothetical protein  43.68 
 
 		 86 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1313  hypothetical protein  37.65 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000232038 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1328  hypothetical protein  37.65 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000844742 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1971  protein YcfR  37.65 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.1704  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4631  hypothetical protein  40.45 
 
 		 93 aa  52  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0445  hypothetical protein  35.56 
 
 		 88 aa  51.6  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00418415 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2155  hypothetical protein  36.47 
 
 		 85 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000201549 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2550  hypothetical protein  45.33 
 
 		 76 aa  50.4  0.000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01108  hypothetical protein  34.12 
 
 		 85 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2535  protein of unknown function DUF1471  34.12 
 
 		 85 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0283942  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1235  hypothetical protein  34.12 
 
 		 85 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1234  hypothetical protein  34.12 
 
 		 85 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.124074  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01116  hypothetical protein  34.12 
 
 		 85 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2489  hypothetical protein  34.12 
 
 		 85 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17858  hitchhiker  0.000290126 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2014  hypothetical protein  34.12 
 
 		 85 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221755 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1492  hypothetical protein  34.12 
 
 		 85 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0142417 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1627  hypothetical protein  35.29 
 
 		 85 aa  48.9  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.884329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2131  protein of unknown function DUF1471  40.7 
 
 		 75 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0887  hypothetical protein  47.06 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0951  hypothetical protein  47.06 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0972  hypothetical protein  47.06 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0860  hypothetical protein  47.06 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0919  hypothetical protein  47.06 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0088  hypothetical protein  35.96 
 
 		 96 aa  47.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0092  probable secreted protein  35.96 
 
 		 96 aa  47.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0406  hypothetical protein  47.06 
 
 		 91 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000937702 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0460  hypothetical protein  47.06 
 
 		 91 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000176876 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0418  hypothetical protein  47.06 
 
 		 91 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.104976  hitchhiker  0.00924869 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0400  hypothetical protein  47.06 
 
 		 91 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0397  hypothetical protein  47.06 
 
 		 91 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.56265  hitchhiker  0.00000000000262215 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0707  protein of unknown function DUF1471  44.71 
 
 		 82 aa  47  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00773  hypothetical protein  36.78 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2836  protein of unknown function DUF1471  36.78 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.680807  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0861  hypothetical protein  36.78 
 
 		 134 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.255089  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2837  hypothetical protein  36.78 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.289732  normal  0.42216 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2544  hypothetical protein  36.78 
 
 		 134 aa  46.2  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0093  probable secreted protein  35.96 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.494057 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00790  hypothetical protein  36.78 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0955  hypothetical protein  36.78 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0818047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0875  hypothetical protein  39.77 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0913603  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0830  hypothetical protein  36.78 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.324676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4739  hypothetical protein  41.51 
 
 		 91 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.236332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4796  hypothetical protein  41.51 
 
 		 91 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.329964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4646  protein YjfN  41.51 
 
 		 91 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4656  protein YjfN  41.51 
 
 		 91 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4775  hypothetical protein  41.51 
 
 		 91 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1056  hypothetical protein  36.36 
 
 		 91 aa  44.7  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0107065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3695  protein of unknown function DUF1471  36.78 
 
 		 82 aa  44.7  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.648566  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0088  hypothetical protein  34.83 
 
 		 96 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.596949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0367  hypothetical protein  39.62 
 
 		 95 aa  44.3  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0286691 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1844  hypothetical protein  39.53 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3825  hypothetical protein  37.74 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000178738 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3050  hypothetical protein  34.48 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.391134  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04017  hypothetical protein  37.74 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>