45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A0418 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A0406  hypothetical protein  100 
 
 
91 aa  181  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000937702 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0460  hypothetical protein  100 
 
 
91 aa  181  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000176876 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0418  hypothetical protein  100 
 
 
91 aa  181  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.104976  hitchhiker  0.00924869 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0400  hypothetical protein  100 
 
 
91 aa  181  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0397  hypothetical protein  100 
 
 
91 aa  181  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.56265  hitchhiker  0.00000000000262215 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0360  hypothetical protein  74.73 
 
 
91 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.503076  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0400  hypothetical protein  74.73 
 
 
91 aa  137  7e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0395  hypothetical protein  73.63 
 
 
91 aa  135  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3277  protein of unknown function DUF1471  72.53 
 
 
91 aa  133  9e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00284  hypothetical protein  72.53 
 
 
91 aa  133  9e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3295  hypothetical protein  72.53 
 
 
91 aa  133  9e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00288  hypothetical protein  72.53 
 
 
91 aa  133  9e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0353  hypothetical protein  72.53 
 
 
91 aa  133  9e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1056  hypothetical protein  62.64 
 
 
91 aa  117  4.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0107065  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4631  hypothetical protein  39.53 
 
 
93 aa  63.9  0.0000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3824  hypothetical protein  43.53 
 
 
89 aa  60.5  0.000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3747  hypothetical protein  40.24 
 
 
89 aa  51.2  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0166  hypothetical protein  40.24 
 
 
89 aa  51.2  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.650256  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3987  hypothetical protein  40.24 
 
 
89 aa  51.2  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3538  protein YcfR  47.06 
 
 
87 aa  47.4  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3721  protein YcfR  47.06 
 
 
87 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3534  protein YcfR  47.06 
 
 
87 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.780594  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3427  protein YcfR  47.06 
 
 
87 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.928315  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0468  hypothetical protein  47.06 
 
 
87 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.291673 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0468  protein of unknown function DUF1471  47.06 
 
 
87 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4555  protein YcfR  47.06 
 
 
104 aa  47  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.421105  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03098  hypothetical protein  47.06 
 
 
87 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3763  hypothetical protein  34.94 
 
 
87 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0643388  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3618  hypothetical protein  34.94 
 
 
87 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3969  hypothetical protein  34.94 
 
 
87 aa  43.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.206164  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00790  hypothetical protein  33.33 
 
 
86 aa  40.8  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00773  hypothetical protein  33.33 
 
 
86 aa  40.8  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0955  hypothetical protein  33.33 
 
 
86 aa  40.8  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0818047  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2837  hypothetical protein  33.33 
 
 
86 aa  40.8  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.289732  normal  0.42216 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2836  protein of unknown function DUF1471  33.33 
 
 
86 aa  40.8  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.680807  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0467  hypothetical protein  38.6 
 
 
87 aa  40.4  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000103446  normal  0.799705 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2155  hypothetical protein  34.15 
 
 
85 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000201549 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2014  hypothetical protein  35.37 
 
 
85 aa  40  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000221755 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2489  hypothetical protein  35.37 
 
 
85 aa  40  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17858  hitchhiker  0.000290126 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1234  hypothetical protein  35.37 
 
 
85 aa  40  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.124074  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1235  hypothetical protein  35.37 
 
 
85 aa  40  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1492  hypothetical protein  35.37 
 
 
85 aa  40  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0142417 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2535  protein of unknown function DUF1471  35.37 
 
 
85 aa  40  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0283942  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01108  hypothetical protein  35.37 
 
 
85 aa  40  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01116  hypothetical protein  35.37 
 
 
85 aa  40  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>