136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0467 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_0467  hypothetical protein  100 
 
 
87 aa  174  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000103446  normal  0.799705 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3618  hypothetical protein  68.97 
 
 
87 aa  126  8.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3969  hypothetical protein  68.97 
 
 
87 aa  126  8.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.206164  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3763  hypothetical protein  68.97 
 
 
87 aa  126  8.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0643388  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0466  hypothetical protein  64.37 
 
 
87 aa  117  4.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000249434  normal  0.799705 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03098  hypothetical protein  60.92 
 
 
87 aa  114  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0468  protein of unknown function DUF1471  60.92 
 
 
87 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3427  protein YcfR  60.92 
 
 
87 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.928315  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3721  protein YcfR  60.92 
 
 
87 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4555  protein YcfR  60.92 
 
 
104 aa  112  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.421105  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0468  hypothetical protein  60.92 
 
 
87 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.291673 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3534  protein YcfR  60.92 
 
 
87 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.780594  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3538  protein YcfR  60.92 
 
 
87 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3624  hypothetical protein  56.32 
 
 
87 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.392206 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3721  hypothetical protein  56.32 
 
 
87 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.344064 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3659  hypothetical protein  55.17 
 
 
87 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187702  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3552  protein YhcN  55.17 
 
 
87 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3553  protein YhcN  55.17 
 
 
87 aa  104  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.554775  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3673  hypothetical protein  52.87 
 
 
87 aa  102  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.444536 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3674  hypothetical protein  50 
 
 
88 aa  88.2  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.45062 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3722  hypothetical protein  48.86 
 
 
88 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.414513 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3625  hypothetical protein  48.86 
 
 
88 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.266928 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3553  hypothetical protein  48.86 
 
 
88 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3660  hypothetical protein  48.86 
 
 
88 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.332792  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3554  hypothetical protein  48.86 
 
 
88 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.563854  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3987  hypothetical protein  40.45 
 
 
89 aa  68.2  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3747  hypothetical protein  40.45 
 
 
89 aa  68.2  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0166  hypothetical protein  40.45 
 
 
89 aa  68.2  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.650256  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3824  hypothetical protein  41.11 
 
 
89 aa  60.8  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0088  hypothetical protein  41.57 
 
 
96 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0092  probable secreted protein  41.57 
 
 
96 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4658  protein YjfY  44.3 
 
 
91 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1488  hypothetical protein  41.18 
 
 
86 aa  57.4  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1779  hypothetical protein  41.18 
 
 
86 aa  57  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.23903 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1595  hypothetical protein  41.18 
 
 
86 aa  57  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0088  hypothetical protein  40.45 
 
 
96 aa  57  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.596949  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0093  probable secreted protein  40.45 
 
 
96 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.494057 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3924  protein of unknown function DUF1471  41.38 
 
 
85 aa  56.2  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4760  hypothetical protein  43.84 
 
 
91 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04028  hypothetical protein  43.84 
 
 
91 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04066  hypothetical protein  43.84 
 
 
91 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3794  protein of unknown function DUF1471  43.84 
 
 
91 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.040427  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4443  hypothetical protein  43.84 
 
 
91 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5715  hypothetical protein  43.84 
 
 
91 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.558368  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3814  hypothetical protein  43.84 
 
 
91 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0544212 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4670  hypothetical protein  43.84 
 
 
91 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.915297  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4732  hypothetical protein  43.84 
 
 
91 aa  54.7  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.264602  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4668  protein YjfY  41.77 
 
 
91 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.192543  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1291  hypothetical protein  42.67 
 
 
123 aa  53.5  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0900385  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0445  hypothetical protein  37.65 
 
 
88 aa  53.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00418415 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0028  protein of unknown function DUF1471  39.47 
 
 
85 aa  51.6  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.20234  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0370  hypothetical protein  40.51 
 
 
91 aa  50.4  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.114454  normal  0.0265365 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4110  protein of unknown function DUF1471  40.28 
 
 
85 aa  50.4  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0022  hypothetical protein  38.16 
 
 
85 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2039  protein of unknown function DUF1471  31.11 
 
 
314 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00133336  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4435  hypothetical protein  37.21 
 
 
86 aa  47.4  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.977465 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00773  hypothetical protein  34.48 
 
 
86 aa  47  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0955  hypothetical protein  34.48 
 
 
86 aa  47  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0818047  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2836  protein of unknown function DUF1471  34.48 
 
 
86 aa  47  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.680807  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00790  hypothetical protein  34.48 
 
 
86 aa  47  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2837  hypothetical protein  34.48 
 
 
86 aa  47  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.289732  normal  0.42216 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00769  hypothetical protein  41.38 
 
 
86 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0951  hypothetical protein  41.38 
 
 
86 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2840  protein of unknown function DUF1471  41.38 
 
 
86 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00786  hypothetical protein  41.38 
 
 
86 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0857  hypothetical protein  41.38 
 
 
86 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0861  hypothetical protein  35.63 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.255089  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0870  hypothetical protein  41.38 
 
 
86 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4631  hypothetical protein  31.46 
 
 
93 aa  46.2  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2841  hypothetical protein  41.38 
 
 
86 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.907908  normal  0.0578067 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0830  hypothetical protein  35.63 
 
 
86 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.324676  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2544  hypothetical protein  35.63 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01573  hypothetical protein  31.11 
 
 
314 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1829  hypothetical protein  33.33 
 
 
317 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.74351  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1679  YdgH protein  31.11 
 
 
314 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.434998  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0875  hypothetical protein  35.63 
 
 
134 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0913603  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1812  YdgH protein  31.11 
 
 
314 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00909814  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2109  hypothetical protein  35.16 
 
 
317 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.129908  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2297  hypothetical protein  33.33 
 
 
317 aa  45.8  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1940  hypothetical protein  33.33 
 
 
317 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2026  hypothetical protein  31.11 
 
 
314 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01563  hypothetical protein  31.11 
 
 
314 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.885779  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1595  YdgH protein  31.11 
 
 
314 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0332868  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2314  YdgH protein  31.11 
 
 
314 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.842613  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1790  YdgH protein  31.11 
 
 
314 aa  46.2  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0421075  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2131  protein of unknown function DUF1471  36.47 
 
 
75 aa  45.4  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3695  protein of unknown function DUF1471  34.48 
 
 
82 aa  45.1  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.648566  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0826  hypothetical protein  40.23 
 
 
86 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4432  hypothetical protein  31.18 
 
 
95 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5704  hypothetical protein  31.18 
 
 
95 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4748  hypothetical protein  31.18 
 
 
95 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.644258  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4659  hypothetical protein  31.18 
 
 
95 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.642992 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2550  hypothetical protein  44 
 
 
76 aa  44.7  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4775  hypothetical protein  37.5 
 
 
91 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4656  protein YjfN  37.5 
 
 
91 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4739  hypothetical protein  37.5 
 
 
91 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.236332  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4796  hypothetical protein  37.5 
 
 
91 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.329964  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4646  protein YjfN  37.5 
 
 
91 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1578  protein YdgH  33.33 
 
 
314 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.505829  normal  0.109067 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1696  protein YdgH  33.33 
 
 
314 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00255729  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>