117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_3618 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3618  hypothetical protein  100 
 
 		 87 aa  179  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3969  hypothetical protein  100 
 
 		 87 aa  179  1e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.206164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3763  hypothetical protein  100 
 
 		 87 aa  179  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0643388  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0467  hypothetical protein  68.97 
 
 		 87 aa  126  8.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000103446  normal  0.799705 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0466  hypothetical protein  64.37 
 
 		 87 aa  115  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000249434  normal  0.799705 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03098  hypothetical protein  55.17 
 
 		 87 aa  105  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0468  protein of unknown function DUF1471  54.02 
 
 		 87 aa  102  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4555  protein YcfR  54.02 
 
 		 104 aa  102  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.421105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3673  hypothetical protein  52.87 
 
 		 87 aa  102  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.444536 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3427  protein YcfR  54.02 
 
 		 87 aa  102  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.928315  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3721  protein YcfR  54.02 
 
 		 87 aa  102  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0468  hypothetical protein  54.02 
 
 		 87 aa  102  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.291673 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3534  protein YcfR  54.02 
 
 		 87 aa  102  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.780594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3538  protein YcfR  54.02 
 
 		 87 aa  102  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3553  protein YhcN  54.02 
 
 		 87 aa  100  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.554775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3552  protein YhcN  54.02 
 
 		 87 aa  99  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3624  hypothetical protein  52.87 
 
 		 87 aa  98.2  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.392206 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3721  hypothetical protein  52.87 
 
 		 87 aa  97.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.344064 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3659  hypothetical protein  52.87 
 
 		 87 aa  96.7  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3674  hypothetical protein  45.45 
 
 		 88 aa  85.9  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.45062 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3625  hypothetical protein  45.45 
 
 		 88 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.266928 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3660  hypothetical protein  45.45 
 
 		 88 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.332792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3554  hypothetical protein  45.45 
 
 		 88 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.563854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3553  hypothetical protein  45.45 
 
 		 88 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3722  hypothetical protein  45.45 
 
 		 88 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.414513 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1488  hypothetical protein  45.35 
 
 		 86 aa  70.9  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1779  hypothetical protein  45.35 
 
 		 86 aa  70.5  0.000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.23903 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1595  hypothetical protein  45.35 
 
 		 86 aa  70.5  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3924  protein of unknown function DUF1471  35.63 
 
 		 85 aa  57.4  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3987  hypothetical protein  33.71 
 
 		 89 aa  56.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3747  hypothetical protein  33.71 
 
 		 89 aa  56.2  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0166  hypothetical protein  33.71 
 
 		 89 aa  56.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.650256  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01108  hypothetical protein  39.08 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2535  protein of unknown function DUF1471  39.08 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0283942  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01116  hypothetical protein  39.08 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1235  hypothetical protein  39.08 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1234  hypothetical protein  39.08 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.124074  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2489  hypothetical protein  39.08 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17858  hitchhiker  0.000290126 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2014  hypothetical protein  39.08 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221755 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1492  hypothetical protein  39.08 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0142417 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0028  protein of unknown function DUF1471  34.88 
 
 		 85 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.20234  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3536  protein of unknown function DUF1471  39.33 
 
 		 83 aa  52.8  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.177081  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4110  protein of unknown function DUF1471  36.11 
 
 		 85 aa  51.6  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2039  protein of unknown function DUF1471  31.11 
 
 		 314 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00133336  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1290  protein YcfR  39.53 
 
 		 85 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1313  hypothetical protein  38.37 
 
 		 85 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000232038 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1328  hypothetical protein  38.37 
 
 		 85 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000844742 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1971  protein YcfR  38.37 
 
 		 85 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.1704  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01573  hypothetical protein  31.11 
 
 		 314 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1291  hypothetical protein  36.36 
 
 		 123 aa  50.1  0.000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0900385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1679  YdgH protein  31.11 
 
 		 314 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.434998  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1812  YdgH protein  31.11 
 
 		 314 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00909814  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2026  hypothetical protein  31.11 
 
 		 314 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01563  hypothetical protein  31.11 
 
 		 314 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.885779  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1595  YdgH protein  31.11 
 
 		 314 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0332868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1790  YdgH protein  31.11 
 
 		 314 aa  50.4  0.000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0421075  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2314  YdgH protein  31.11 
 
 		 314 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.842613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1627  hypothetical protein  37.93 
 
 		 85 aa  49.7  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.884329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3824  hypothetical protein  36.71 
 
 		 89 aa  50.1  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1829  hypothetical protein  31.11 
 
 		 317 aa  48.9  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.74351  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2109  hypothetical protein  35.16 
 
 		 317 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.129908  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2297  hypothetical protein  31.11 
 
 		 317 aa  48.9  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1940  hypothetical protein  31.11 
 
 		 317 aa  48.9  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0088  hypothetical protein  32.58 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0092  probable secreted protein  32.58 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2155  hypothetical protein  37.21 
 
 		 85 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000201549 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0022  hypothetical protein  31.4 
 
 		 85 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1587  hypothetical protein  34.44 
 
 		 314 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.48706  normal  0.33629 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1646  hypothetical protein  34.44 
 
 		 314 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.79499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0093  probable secreted protein  32.58 
 
 		 96 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.494057 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1578  protein YdgH  34.44 
 
 		 314 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.505829  normal  0.109067 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1696  protein YdgH  34.44 
 
 		 314 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00255729  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1863  hypothetical protein  34.44 
 
 		 314 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.335032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2402  protein of unknown function DUF1471  32.97 
 
 		 317 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.326621  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00773  hypothetical protein  31.71 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2836  protein of unknown function DUF1471  31.71 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.680807  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00790  hypothetical protein  31.71 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2837  hypothetical protein  31.71 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.289732  normal  0.42216 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0088  hypothetical protein  31.46 
 
 		 96 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.596949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0955  hypothetical protein  31.71 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0818047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0861  hypothetical protein  31.71 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.255089  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2544  hypothetical protein  31.71 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0875  hypothetical protein  31.71 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0913603  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0830  hypothetical protein  31.71 
 
 		 86 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.324676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4435  hypothetical protein  34.12 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.977465 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0406  hypothetical protein  34.94 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000937702 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0460  hypothetical protein  34.94 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000176876 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0418  hypothetical protein  34.94 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.104976  hitchhiker  0.00924869 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0400  hypothetical protein  34.94 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0397  hypothetical protein  34.94 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.56265  hitchhiker  0.00000000000262215 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0951  hypothetical protein  37.65 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0442  hypothetical protein  29.11 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.836978  hitchhiker  0.000475727 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0445  hypothetical protein  36.47 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00418415 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2586  hypothetical protein  28.09 
 
 		 316 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4739  hypothetical protein  36.21 
 
 		 91 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.236332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4796  hypothetical protein  36.21 
 
 		 91 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.329964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4646  protein YjfN  36.21 
 
 		 91 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4656  protein YjfN  36.21 
 
 		 91 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4775  hypothetical protein  36.21 
 
 		 91 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4432  hypothetical protein  36.21 
 
 		 95 aa  41.6  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>